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J-GLOBAL ID：201802250736136414   整理番号：18A0995957

膜蛋白質構造データベースの比較分析【JST・京大機械翻訳】

Comparative analysis of membrane protein structure databases

著者 (5件)： Shimizu Kentaro (Department of Biotechnology, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Cao Wei (Faculty of Information Networking for Innovation and Design, Toyo University, Tokyo, Japan) ,  Saad Gull (Department of Biotechnology, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Shoji Michiru (Department of Biotechnology, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Terada Tohru (Agricultural Bioinformatics Research Unit, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan)
資料名： Biochimica et Biophysica Acta  (Biochimica et Biophysica Acta)
巻： 1860  号： 5  ページ： 1077-1091  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0207A  ISSN： 0005-2728  CODEN： BBBMBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 膜蛋白質は,輸送体,受容体,アンカーおよび酵素として機能するので,細胞生存および細胞コミュニケーションにおいて重要な役割を果たしている。それらはまた,受容体をブロックするか,または疾患に関連する酵素を阻害する薬物の潜在的標的である。膜蛋白質の既知構造の数は全体としてプロテオームのサイズに対して依然として小さいが,多くの新しい膜蛋白質構造が最近決定されている。広く使用されている膜蛋白質データベース,mprstrc,膜(OPM)およびPDBTMにおける蛋白質の配向を比較し解析し,その分類分野が「膜蛋白質」であることを示すPDB構造および蛋白質(SCOP)クラスFドメインを持つ蛋白質を示した。これらのデータベースまたはデータセット間の関係を,それらのコンテンツの重なりと構造的,トポロジー的および機能的分類,および膜貫通ドメイン割当における一貫性の程度に基づいて評価した。膜データベースはそれらの範囲において互いに異なり,アノテーションと分類に使用する基準において異なる。これらのデータベースの効率的な利用を保証するために,それらの差異と類似性を理解することが重要である。膜蛋白質の配列,構造,膜会合及び機能に対するより詳細で一貫した注釈の確立が必要であり,実験的に決定された構造の最近の成長を考慮すると,膜蛋白質構造データベースで提示された知識の総和の広範な調査及び累積分析は膜蛋白質の構造及び機能の解明に役立つ。また,膜蛋白質の将来の研究と分類のための枠組みを提供することを目的とした。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： コミュニケーション ,  *膜タンパク質 ,  *タンパク質 ,  コンテンツ ,  位相幾何学 ,  アノテーション ,  受容体 ,  *データベース ,  類似性 ,  プロテオーム ,  酵素 ,  *タンパク質構造 ,  膜貫通領域 ,  ドメイン構造 ,  細胞生存

著者キーワード (7件)： 膜蛋白質 ,  蛋白質構造 ,  蛋白質ドメイン ,  膜貫通セグメント ,  データベース ,  分類 ,  注釈

分類 (4件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (3件)： 膜蛋白質構造 ,  データベース ,  比較分析