文献

J-GLOBAL ID：201802251104403016   整理番号：18A1477624

Flammulina velutipesのde novoトランスクリプトーム配列決定は低温誘導性結実に関連する候補遺伝子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

De novo transcriptome sequencing of Flammulina velutipes uncover candidate genes associated with cold-induced fruiting

著者 (10件)： Wu Tuheng (College of Food Science and Institute of Food Biotechnology, South China Agricultural University, Guangzhou, P.R. China) ,  Wu Tuheng (Research Center for Micro-Ecological Agent Engineering and Technology of Guangdong Province, Guangzhou, P.R. China) ,  Ye Zhiwei (College of Food Science and Institute of Food Biotechnology, South China Agricultural University, Guangzhou, P.R. China) ,  Ye Zhiwei (Research Center for Micro-Ecological Agent Engineering and Technology of Guangdong Province, Guangzhou, P.R. China) ,  Guo Liqiong (College of Food Science and Institute of Food Biotechnology, South China Agricultural University, Guangzhou, P.R. China) ,  Guo Liqiong (Research Center for Micro-Ecological Agent Engineering and Technology of Guangdong Province, Guangzhou, P.R. China) ,  Yang Xueqin (College of Food Science and Institute of Food Biotechnology, South China Agricultural University, Guangzhou, P.R. China) ,  Yang Xueqin (Research Center for Micro-Ecological Agent Engineering and Technology of Guangdong Province, Guangzhou, P.R. China) ,  Lin Junfang (College of Food Science and Institute of Food Biotechnology, South China Agricultural University, Guangzhou, P.R. China) ,  Lin Junfang (Research Center for Micro-Ecological Agent Engineering and Technology of Guangdong Province, Guangzhou, P.R. China)
資料名： Journal of Basic Microbiology  (Journal of Basic Microbiology)
巻： 58  号： 8  ページ： 698-703  発行年： 2018年 
JST資料番号： T0359A  ISSN： 0233-111X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 東アジアにおける最も一般的な食用菌類の1つであるFlammulina velutipesにおける低温誘導子実体の分子機構を理解するために,F.velutipesトランスクリプトームのde novo集合を行った。F.velutipesの菌糸体と原基から得られた,それぞれ,26,888,494,および26,275,146のクリーンな読み取りがあった。合計20,157の単一遺伝子をde novoで組み立て,それらの15058を注釈した。さらに,7935の単一遺伝子は菌糸体と原基の間で差別的に発現し,それらの4025は上方制御され,3910は下方制御された。差次的に発現した単一遺伝子のGOおよびKEGG経路分析は,二成分シグナル伝達経路,カルシウムシグナリング,活性化蛋白質キナーゼ経路,分子シャペロン,細胞壁および膜系に関連する機能的グループがF.velutipesの低温誘導子実体において重要な役割を果たすことを示した。本研究では,643のEST-SSRを20,157の単一遺伝子で同定し,1560のEST-SSRプライマー対を設計した。さらに,5548と5955のSNPが菌糸体と原基でそれぞれ検出された。結果として,本研究の結果は,F.velutipesにおける低温誘導子実体の機能的ゲノミクス研究のための価値ある資源として役立つことができる。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *低温 ,  *トランスクリプトーム ,  *結実 ,  タンパク質キナーゼ ,  アップレギュレーション ,  子実体 ,  ダウンレギュレーション ,  細胞壁 ,  菌糸 ,  *エノキタケ属
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  プラコード ,  *候補遺伝子 ,  *エノキタケ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 低温誘起開始 ,  de novoトランスクリプトーム ,  EST-SSRS ,  Flammulina velutipes ,  SNPs

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： Flammulina ,  トランスクリプトーム ,  低温 ,  結実 ,  候補遺伝子