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J-GLOBAL ID：201802251184546696   整理番号：18A2190754

ブタFUT2遺伝子コドン使用選好分析及び最適化【JST・京大機械翻訳】

Analysis and Optimization of Codon Usage Bias of Porcine FUT2 Gene

著者 (5件)： Dai Kaiyu (揚州大学動物科学与技術学院,江蘇省動物遺伝繁育与分子設計重点実験室,揚州225009) ,  Huang Yanjie (揚州大学動物科学与技術学院,江蘇省動物遺伝繁育与分子設計重点実験室,揚州225009) ,  Wu Lisi (揚州大学動物科学与技術学院,江蘇省動物遺伝繁育与分子設計重点実験室,揚州225009) ,  Bao Wenbin (揚州大学動物科学与技術学院,江蘇省動物遺伝繁育与分子設計重点実験室,揚州225009;江蘇省現代農業(生猪)産業技術体系良種繁育創新団隊,揚州225009) ,  Wu Shenglong (揚州大学動物科学与技術学院,江蘇省動物遺伝繁育与分子設計重点実験室,揚州225009;江蘇省現代農業(生猪)産業技術体系良種繁育創新団隊,揚州225009)
資料名： Zhongguo Xumu Shouyi  (Zhongguo Xumu Shouyi)
巻： 45  号： 7  ページ： 1863-1872  発行年： 2018年 
JST資料番号： C3580A  ISSN： 1671-7236  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ブタのα-(1,2)フコシルトランスフェラーゼ2(FUT2)遺伝子コドンの使用特性を明らかにし,外因性宿主でのその発現量を高めた。本研究では、EMBOSSExplorerウェブサイトとCodonWソフトパッケージを用いて、ブタFUT2遺伝子のコドン使用選好性の関連パラメータを分析し、3種類のモデル生物(大腸菌、酵母菌とショウジョウバエ)のゲノムコドン使用モデルと比較した。最後に、最も近いパターンの生物ゲノムコドンの利用方式を参考に、JCatとOPTIMIZERの2つのコドン最適化サイトを用いて、ブタFUT2遺伝子コドンを最適化した。その結果,ブタFUT2遺伝子の発現レベルは高くなく,24種のコドンが好ましく,23種がG/Cで終わることを示した。ブタFUT2遺伝子とショウジョウバエのゲノムコドン使用パターンの差異は大腸菌と酵母ゲノムより低く、ショウジョウバエはブタFUT2遺伝子の外因性発現にもっと適していることが明らかになった。ショウジョウバエのゲノムコドンの使用パターンにより、ブタFUT2遺伝子コドンを最適化し、最適化後、その適応指数は明らかに向上し、全体のGC含量は明らかな変化がなく、理論上のブタFUT2遺伝子の最適化に成功した。本研究では、翻訳レベルからブタFUT2遺伝子のコドン使用特性を明らかにし、遺伝的改良において最適な外因性発現系の選択及び宿主細胞内の発現レベルの向上に一定の理論根拠を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酵母 ,  フコシルトランスフェラーゼ ,  ショウジョウバエ ,  ゲノム ,  大腸菌 ,  *遺伝子 ,  *最適化 ,  *コドン ,  パラメータ ,  嗜好性
準シソーラス用語： 宿主細胞 ,  遺伝育種 ,  GC含量 ,  コドン最適化 ,  Codon , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： ブタ ,  遺伝子 ,  コドン ,  選好 ,  分析 ,  最適化