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J-GLOBAL ID：201802252004251164   整理番号：18A0324157

分子シミュレーションによるOprH LPS相互作用の精密化【Powered by NICT】

Refinement of OprH-LPS Interactions by Molecular Simulations

著者 (10件)： Lee Joonseong (Department of Biological Sciences, Lehigh University, Bethlehem, Pennsylvania) ,  Lee Joonseong (Bioengineering Program, Lehigh University, Bethlehem, Pennsylvania) ,  Patel Dhilon S. (Department of Biological Sciences, Lehigh University, Bethlehem, Pennsylvania) ,  Patel Dhilon S. (Bioengineering Program, Lehigh University, Bethlehem, Pennsylvania) ,  Kucharska Iga (Center for Membrane and Cell Physiology, University of Virginia School of Medicine, Charlottesville, Virginia) ,  Kucharska Iga (Department of Molecular Physiology and Biological Physics, University of Virginia School of Medicine, Charlottesville, Virginia) ,  Tamm Lukas K. (Center for Membrane and Cell Physiology, University of Virginia School of Medicine, Charlottesville, Virginia) ,  Tamm Lukas K. (Department of Molecular Physiology and Biological Physics, University of Virginia School of Medicine, Charlottesville, Virginia) ,  Im Wonpil (Department of Biological Sciences, Lehigh University, Bethlehem, Pennsylvania) ,  Im Wonpil (Bioengineering Program, Lehigh University, Bethlehem, Pennsylvania)
資料名： Biophysical Journal  (Biophysical Journal)
巻： 112  号： 2  ページ： 346-355  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0298A  ISSN： 0006-3495  CODEN： BIOJAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： グラム陰性菌の外膜(OM)は内部小葉の外小葉とりん脂質のリポ多糖類(LPS)で構成されている。緑膿菌の外膜蛋白質H(OprH)はLPSと相互作用する直接OMsに増加した安定性を提供する。ここでは,全原子分子動力学シミュレーションを用いてOMsとOprHの物理的性質に及ぼす種々のP.aeruginosaと,比較のために,大腸菌LPS環境の影響を報告した。シミュレーションはP.aeruginosa OMsはE.coli OMs,リピドAのアシル鎖長の違いから期待されるよりも薄い疎水性二分子層であるが,この効果はOprHとOMの間に動的に調整疎水性整合によるOprHであるほぼ知覚できないことを明らかにした。OprHの細胞外ループの構造と動力学を,異なるLPS環境において異なる挙動を示した。O抗原はOprHループの柔軟性を大きく低減すること,およびこれらのループとLPS間の相互作用を増加させた。さらに著者らの研究は,OprH及びLPS間の相互作用は主にOprHの二次構造とLPSの化学構造に依存し,異なるLPS環境における特徴的なパターンをもたらすことを示した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 緑膿菌 ,  二次構造 ,  リン脂質 ,  疎水性 ,  グラム陰性菌 ,  リピドA ,  外膜タンパク質 ,  リポ多糖類 ,  二分子層 ,  大腸菌 ,  *相互作用 ,  O抗原
準シソーラス用語： 化学構造 ,  外膜 ,  *分子シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (4件)： 分子シミュレーション ,  LPS ,  相互作用 ,  精密化