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J-GLOBAL ID：201802252105097891   整理番号：18A0966197

ダイコン(Raphanus sativus L.)における開花遺伝子のゲノムワイド同定,特性化および進化分析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification, characterization, and evolutionary analysis of flowering genes in radish ( Raphanus sativus L.)

著者 (10件)： Wang Jinglei (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Qiu Yang (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Cheng Feng (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Chen Xiaohua (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Zhang Xiaohui (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Wang Haiping (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Song Jiangping (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Duan Mengmeng (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Yang Haohui (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Li Xixiang (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 981  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ダイコン(Rapanus sativus L.)はアブラナ科に属し,世界中で栽培されている経済的に重要な根作物である。開花は植物の繁殖に必要であるが,植物成長と生殖成長の間の不均衡の場合には,R.sativusの果肉収量と品質に影響を及ぼす重要な農業形質である。現在,R.sativusにおける開花遺伝子またはそれらの進化を制御する経路に関する詳細な情報が不足している。R.sativusゲノム配列の放出は,比較ゲノミクスアプローチを用いて開花遺伝子を同定し特性化する機会を提供する。著者らは,配列類似性に基づく254のR.sativus開花遺伝子とsynニー領域の分析を同定した。遺伝子は様々な染色体上に不均一に分布していた。さらに著者らは,開花調節ネットワークにおけるR.sativusコア機能遺伝子の存在を発見した。それは,基本的な開花経路がArabidopsis thalianaとR.sativusの間で比較的保存されていることを明らかにした。Brassica oleraceaとBrassica rapaとの付加的な比較は,保持された開花遺伝子がゲノム3回化イベント後の種間で異なることを示した。R.sativusの開花遺伝子は優先的に保持され,特にジベレリンのシグナル伝達と代謝に関連した。さらに,選択圧の分析により,春化と自律的経路における遺伝子が他のR.sativus開花経路における遺伝子よりも可変であることを示唆した。著者らの結果は,コア開花遺伝子がR.sativusとA.thalianaの間である程度保存されていることを明らかにした。さらに,R.sativusにおける相同遺伝子のコピー数変異および機能的分化は,ゲノム倍数化後の開花調節ネットワークの複雑性を増加させた。著者らの研究は,R.sativusの開花経路に対する統合された枠組みを提供し,R.sativusの開花遺伝子とA.thalianaおよび近縁の近縁種からの遺伝子の間の進化的関係への洞察を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 品質 ,  変異 ,  植物成長 ,  分化 ,  *キャラクタリゼーション ,  *開花 ,  *ゲノム ,  *ダイコン ,  コピー数 ,  ネットワーク ,  Arabidopsis thaliana ,  ジベレリン ,  *遺伝子 ,  バーナリゼーション
準シソーラス用語： ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ダイコン ,  ゲノムワイド ,  開花遺伝子 ,  調節経路ネットワーク ,  進化

分類 (2件)： 野菜  (FC03043X) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (57件)：

• Cell; SnapShot: control of flowering in Arabidopsis; F Fornara, A de Montaigu, G Coupland; 141; 2010; 550-550; 10.1016/j.cell.2010.04.024; citation_id=CR1
• Peng FY, Hu Z, Yang RC. Genome-wide comparative analysis of flowering-related genes in Arabidopsis, wheat, and barley. Int J Plant Prod. 2015:874361-1.
• Kim MY, Kang YJ, Lee T, Lee SH. Divergence of flowering-related genes in three legume species. Plant Genome. 2013;6(3)
• Nature; Unravelling angiosperm genome evolution by phylogenetic analysis of chromosomal duplication events; JE Bowers, BA Chapman, JK Rong, AH Paterson; 422; 6930; 2003; 433-438; 10.1038/nature01521; citation_id=CR4
• Plant Cell; Comparative genomics of Brassica oleracea and Arabidopsis thaliana reveal gene loss, fragmentation, and dispersal after polyploidy; CD Town, F Cheung, R Maiti, J Crabtree, BJ Haas, JR Wortman, EE Hine, R Althoff, TS Arbogast, LJ Tallon; 18; 6; 2006; 1348-1359; 10.1105/tpc.106.041665; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (9件)： ダイコン ,  Raphanus ,  開花 ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  同定 ,  特性化 ,  進化 ,  分析