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J-GLOBAL ID：201802252986978942   整理番号：18A0390799

Serratia marcescensのストレプトマイシン3′′-アデニリルトランスフェラーゼの強力な阻害剤の計算的同定【Powered by NICT】

Computational identification of potent inhibitors for Streptomycin 3′′-adenylyltransferase of Serratia marcescens

著者 (3件)： Prabhu Dhamodharan (Department of Bioinformatics, Alagappa University, Science Campus, Karaikudi 630004, Tamil Nadu, India) ,  Vidhyavathi Ramasamy (Department of Bioinformatics, Alagappa University, Science Campus, Karaikudi 630004, Tamil Nadu, India) ,  Jeyakanthan Jeyaraman (Department of Bioinformatics, Alagappa University, Science Campus, Karaikudi 630004, Tamil Nadu, India)
資料名： Microbial Pathogenesis  (Microbial Pathogenesis)
巻： 103  ページ： 94-106  発行年： 2017年 
JST資料番号： T0489A  ISSN： 0882-4010  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Serratia marcescensはヒトにおける呼吸器および尿路感染症の原因となる日和見病原体である。霊菌の抗生物質耐性機構は抗生物質の不活性化のための位置特異的移動による抗生物質基板からアデニル基を輸送するアミノグリコシド修飾酵素を介して仲介される。ストレプトマイシン3~′′-アデニリルトランスフェラーゼは抗生物質の3′位に作用し,細菌の抗生物質耐性を克服するための新しい薬物標的として考えられている。これまで,S.marcescensにおけるストレプトマイシン3′′-アデニリルトランスフェラーゼの結晶構造を解析し実験的にされていない。それ故,本研究では,結合機構を理解するためにストレプトマイシン3′′-アデニリルトランスフェラーゼの三次元構造を構築した。モデル化構造は五化学構造データベースからの強力な化合物を同定するための構造に基づく仮想スクリーニングに供した。さらに,分子ドッキング,分子動力学シミュレーション,ADME毒性評価,自由エネルギーと密度汎関数理論計算のような異なった計算方法は最良の五化合物の構造,結合および薬物動態学的特性を予測した。全体として,結果は,五種類の強力な化合物の安定な結合確認は疎水性,π-πスタッキング,塩橋と水素結合相互作用を介して仲介されることを示唆した。同定された化合物は潜在的薬物実体として抗病原体薬の開発への道を開くことができた。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： モデリング ,  抗生物質 ,  酵素 ,  水素結合 ,  計算機シミュレーション ,  疎水性 ,  *霊菌 ,  薬物動力学 ,  病原体 ,  ヒト ,  自由エネルギー ,  結晶構造 ,  データベース
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  分子ドッキング ,  三次元構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Serratia marcescens ,  ホモロジーモデリング ,  構造ベースの仮想スクリーニング ,  密度汎関数理論と分子動力学シミュレーション

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (5件)： Serratia ,  ストレプトマイシン ,  阻害剤 ,  計算 ,  同定