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J-GLOBAL ID：201802253451214607   整理番号：18A1154634

便潜血カードにおける非胎便便の収集は乳児における糞便微生物叢研究の有効な方法である【JST・京大機械翻訳】

Collection of non-meconium stool on fecal occult blood cards is an effective method for fecal microbiota studies in infants

著者 (11件)： Wong Wendy S.W. (Inova Translational Medicine Institute (ITMI), Falls Church, USA) ,  Clemency Nicole (Inova Translational Medicine Institute (ITMI), Falls Church, USA) ,  Klein Elisabeth (Inova Translational Medicine Institute (ITMI), Falls Church, USA) ,  Provenzano Marina (Inova Translational Medicine Institute (ITMI), Falls Church, USA) ,  Iyer Ramaswamy (Inova Translational Medicine Institute (ITMI), Falls Church, USA) ,  Niederhuber John E. (Inova Translational Medicine Institute (ITMI), Falls Church, USA) ,  Niederhuber John E. (Johns Hopkins School of Medicine, Baltimore, USA) ,  Hourigan Suchitra K. (Inova Translational Medicine Institute (ITMI), Falls Church, USA) ,  Hourigan Suchitra K. (Inova Children’s Hospital, Falls Church, USA) ,  Hourigan Suchitra K. (Pediatric Specialists of Virginia, Fairfax, USA) ,  Hourigan Suchitra K. (Johns Hopkins School of Medicine, Baltimore, USA)
資料名： Microbiome (Web)  (Microbiome (Web))
巻： 5  号： 1  ページ： 114  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7333A  ISSN： 2049-2618  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】効果的方法は,大規模な微生物相研究のために小児から糞便サンプルを収集するために必要である。郵送される便潜血検査(FOBT)カードで収集された糞便は,効果的な解決策を提供することができる。しかしながら,この方法から生じる配列決定の質は不明である。本研究の目的は,異なる条件下でEppendorf管(ET)で収集された糞便を持つFOBTカード上で収集された糞便と胎便からの16SリボソームRNA(rRNA)遺伝子配列決定の微生物学的指標を比較することである。【方法】0か月~2歳の小児と3種類の胎便サンプルにおける小児からの8つの糞便サンプルを収集し,以下のように保存した。(1)ETにおける室温(RT)≦2日,ETにおける-80°Cにおける7日,FOBTカード上のRTにおける3~5日,FOBTカード上のRTにおける7日,FOBTカード上の-80°Cにおける7日。-80°Cで貯蔵した試料を直ちに凍結した。各試料/条件は,Illina MiSeq上で複製を伴う16S rRNA遺伝子配列決定を行った。αとβの多様性の測定と主要な門の相対的な豊度を貯蔵条件と容器(ET対FOBTカード)の間で比較し,異なる貯蔵条件とETの-80°Cでの7日の「標準」とET中の新鮮な糞便との間の比較を行った。【結果】スツール試料は,貯蔵条件(P=0.42)または容器(P=0.16)によるよりもむしろ個々のおむつ(P<10~5,Adonis)によって主にクラスタ化された。しかし,80°CにおけるET管に貯蔵された糞便を用いて,7日間,FOBTカード上に貯蔵された糞便間のα多様性測度と相対存在量に差はなかった。しかし,ETにおける新鮮な糞便と比較すると,アルファ多様性の違いが見られた。全体として,クラス内相関係数(ICC)に基づくと,異なる貯蔵容器/条件は,微生物member船の保存において信頼でき,乳児糞便のα多様性と相対的微生物組成を保存するのに信頼性が低い。結論:FOBTカードは,少量の糞便を得ることのできる外来フォローアップを必要とする小児の大規模糞便微生物叢研究に有用なツールである。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相関係数 ,  *乳児 ,  rRNA ,  子供 ,  *ミクロフローラ ,  クラスタ化 ,  測度 ,  *胎便 ,  *微生物 ,  生物指標 ,  おむつ
準シソーラス用語： α多様性 ,  遺伝子配列 ,  16S rRNA ,  *潜血反応 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 便 ,  胎便 ,  微生物 ,  便潜血カード ,  小児 ,  貯蔵

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  微生物の生態  (EG03040J)

引用文献 (20件)：

• BMC Microbiol; Comparison of methods for fecal microbiome biospecimen collection; C Dominianni, J Wu, RB Hayes, J Ahn; 14; 2014; 103; 10.1186/1471-2180-14-103; CR1;
• Cancer Epidemiol Biomark Prev; Collecting fecal samples for microbiome analyses in epidemiology studies; R Sinha, J Chen, A Amir, E Vogtmann, J Shi, KS Inman, R Flores, J Sampson, R Knight, N Chia; 25; 2; 2016; 407-416; 10.1158/1055-9965.EPI-15-0951; CR2;
• Sci Rep; Sample storage conditions significantly influence faecal microbiome profiles; JM Choo, LE Leong, GB Rogers; 5; 2015; 16350; 10.1038/srep16350; CR3;
• Nature; Human gut microbiome viewed across age and geography; T Yatsunenko, FE Rey, MJ Manary, I Trehan, MG Dominguez-Bello, M Contreras, M Magris, G Hidalgo, RN Baldassano, AP Anokhin, AC Heath, B Warner, J Reeder, J Kuczynski, JG Caporaso, CA Lozupone, C Lauber, JC Clemente, D Knights, R Knight, JI Gordon; 486; 7402; 2012; 222-227; CR4;
• PLoS One; Meconium microbiome analysis identifies bacteria correlated with premature birth; AN Ardissone, DM Cruz, AG Davis-Richardson, KT Rechcigl, N Li, JC Drew, R Murgas-Torrazza, R Sharma, ML Hudak, EW Triplett, J Neu; 9; 3; 2014; e90784; 10.1371/journal.pone.0090784; CR5;

タイトルに関連する用語 (9件)： 便 ,  潜血 ,  カード ,  胎便 ,  収集 ,  乳児 ,  糞便 ,  微生物叢 ,  研究