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J-GLOBAL ID:201802254352358774   整理番号:18A2214445

Beninese toffin個体群サンプルにおけるHLA-G,-Eおよび-F調節およびコード領域可変性とハプロタイプ【JST・京大機械翻訳】

HLA-G, -E and -F regulatory and coding region variability and haplotypes in the Beninese Toffin population sample
著者 (24件):
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巻: 104  ページ: 108-127  発行年: 2018年 
JST資料番号: B0850A  ISSN: 0161-5890  CODEN: IMCHAZ  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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HLA-G/E/F遺伝子は免疫調節特性を示し,胎盤で発現する。サブサハラアフリカの個体群におけるこれらの遺伝子の研究にはほとんど注意が払われていないが,それはまだ最も多様である。このギャップを埋めるために,完全な遺伝子変動性,HLA-G(n=149)に対する約5.1kb,HLA-E(n=150)に対する7.7kb,および遠隔Beninese Toffin集団におけるHLA-F(n=152)に対する6.2kbを,大規模並列配列決定を用いて評価した。全体として,96,37および68の可変部位が,それぞれ,全HLA-G,-Eおよび-Fに沿って検出され,領域特異的ハプロタイプに配置されていた。すなわち,プロモーターハプロタイプ(それぞれ16,19および15),コードハプロタイプ(19,15および29),3’非翻訳領域(3′UTR)ハプロタイプ(それぞれ12,7および2)および拡張ハプロタイプ(33,31および32)をコードした。全てのプロモーター/コード化/3’UTRハプロタイプは,世界の個体群で既に記述されたパターンに従った。HLA-Eは最も保存され,主に2つの完全長符号化分子(E*01:01とE*01:03)を示し,HLA-F,3つの完全長蛋白質(F*01:01,F*01:02とF*01:03)とHLA-G,4つの蛋白質:3つの完全長(G*01:01,G*01:03とG*01:04)と1つの短縮(G*01:05N)が続いた。Toffin集団におけるHLA-G/E/F対立遺伝子は世界的に最も頻繁に観察されたが,非アフリカ系(ブラジル)と比較した場合,コードハプロタイプの頻度は他のアフリカ集団(Guinea-Conakry及びBurkina-Faso)と類似しており,これらの遺伝子に沿った可変部位がヒト分散前にアフリカに存在したことを示した。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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遺伝子の構造と化学 

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