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J-GLOBAL ID：201802254435881505   整理番号：18A2160342

レオスケール:個々の蛋白質位置における複数の変異体に対する実験的に決定された置換結果の集約と定量化のためのツール【JST・京大機械翻訳】

RheoScale: A tool to aggregate and quantify experimentally determined substitution outcomes for multiple variants at individual protein positions

著者 (5件)： Hodges Abby M. (Department of Natural, Health, and Mathematical Sciences, MidAmerica Nazarene University, Olathe, Kansas, USA) ,  Fenton Aron W. (The Department of Biochemistry and Molecular Biology, The University of Kansas Medical Center, Kansas City, Kansas, USA) ,  Dougherty Larissa L. (The Department of Biochemistry and Molecular Biology, The University of Kansas Medical Center, Kansas City, Kansas, USA) ,  Overholt Andrew C. (Department of Natural, Health, and Mathematical Sciences, MidAmerica Nazarene University, Olathe, Kansas, USA) ,  Swint-Kruse Liskin (The Department of Biochemistry and Molecular Biology, The University of Kansas Medical Center, Kansas City, Kansas, USA)
資料名： Human Mutation  (Human Mutation)
巻： 39  号： 12  ページ： 1814-1826  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2601A  ISSN： 1059-7794  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト突然変異は,蛋白質機能または安定性を変えることができるアミノ酸変化(変異体)をしばしば引き起こす。いくつかの変異体は,実験的に「レオスタット」突然変異結果を示す蛋白質位置にあり(異なるアミノ酸置換が機能的結果の範囲を導く),個々の位置の全体的役割を記述するために,「トグル」(ほとんどの置換機能)または「中性」(野生型機能を持つ)からレオスタット位置を識別するための定量的スコアを提示する。RheoScaleスコアは,実験データ(結合親和性または安定性など)と構造的および生物情報学的分析との相関を容易にする。RheoScale計算機はMicrosoft ExcelワークブックとRスクリプトに符号化される。3つのモデル蛋白質系について例解析を示し,1つは深い突然変異走査により評価した。RheoScale計算機は迅速かつ効率的に定量的記述を提供し,以前の定性的観察と良く一致した。例として,スコアを例蛋白質の構造と比較した。強いレオスタット位置は動的位置で発生する傾向があった。将来,RheoScaleスコアは,ヒト変異体の結果を予測するための改良アルゴリズムを容易にするために,計算研究に容易に統合できる。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 野生型 ,  アルゴリズム ,  ヒト ,  可変抵抗器 ,  *タンパク質 ,  走査 ,  突然変異 ,  計算機械
準シソーラス用語： 蛋白質構造 ,  Excel ,  バイオインフォマティクス ,  結合親和性 ,  スコア ,  アミノ酸置換 ,  蛋白質機能 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 深部突然変異走査 ,  LACI/GALR ,  個別化医療 ,  蛋白質 ,  ピルビン酸キナーゼ ,  TIMバレル

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (8件)： スケール ,  蛋白質 ,  変異体 ,  実験 ,  置換 ,  集約 ,  定量化 ,  ツール