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J-GLOBAL ID：201802254627067899   整理番号：18A0786109

カナダ,オンタリオ州における2014年発生に重点を置いたエンテロウイルスD68の全球分布と進化史【JST・京大機械翻訳】

Global Distribution and Evolutionary History of Enterovirus D68, with Emphasis on the 2014 Outbreak in Ontario, Canada

著者 (12件)： Eshaghi Alireza (Department of Clinical Laboratory and Microbiology Sciences, Public Health Ontario, Toronto) ,  Duvvuri Venkata R. (Department of Clinical Laboratory and Microbiology Sciences, Public Health Ontario, Toronto) ,  Isabel Sandra (Department of Paediatrics, The Hospital for Sick Children, University of Toronto, Toronto) ,  Banh Philip (Department of Clinical Laboratory and Microbiology Sciences, Public Health Ontario, Toronto) ,  Li Aimin (Department of Clinical Laboratory and Microbiology Sciences, Public Health Ontario, Toronto) ,  Peci Adriana (Department of Clinical Laboratory and Microbiology Sciences, Public Health Ontario, Toronto) ,  Patel Samir N. (Department of Clinical Laboratory and Microbiology Sciences, Public Health Ontario, Toronto) ,  Patel Samir N. (Department of Laboratory Medicine and Pathobiology, University of Toronto, Toronto) ,  Gubbay Jonathan B. (Department of Clinical Laboratory and Microbiology Sciences, Public Health Ontario, Toronto) ,  Gubbay Jonathan B. (Department of Paediatrics, The Hospital for Sick Children, University of Toronto, Toronto) ,  Gubbay Jonathan B. (Department of Laboratory Medicine and Pathobiology, University of Toronto, Toronto) ,  Gubbay Jonathan B. (Department of Microbiology, Mount Sinai Hospital, Toronto)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 257  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 1962年における最初の出現にもかかわらず,ヒトエンテロウイルスD68(EV-D68)は,日本,フィリピン,オランダを含むいくつかの国で発生とクラスターを引き起こした過去10年間に出現した呼吸器病原体として認識されている。重度の呼吸器疾患に関連したEV-D68の最も最近および最大の発生は,2014年8月~2015年1月の間に北米で起こった。2014年9月1日と10月31日の間に,EV-D68感染を,カナダ,オンタリオのウイルスに対して試験した153/907(16.9%)人の間で,リアルタイムRT-PCRとその後の部分VP1遺伝子の配列決定による遺伝子タイピングを用いて確認した。2014年の北米EV-D68発生の進化史を理解するために,利用可能な部分的VP1遺伝子(n=469)とNCBI利用可能な全ゲノム配列(WGS)(n=38)を用いて系統発生学的および系統学的解析を行った。グローバルEV-D68系統樹(n=469)は,以前に報告されたように,プロトタイプEV-D68 Fermon株からの3つの明確なクレードA,B,およびCの発散を再確認した。2つのサブクレード(B1とB2)が同定され,ほとんどの2014のEV-D68株はサブクラスタB2B2(サブクレードB2内の2つの出現クラスターの1つ)に属し,それぞれVP1遺伝子のBCとDEループにT650AとM700Vを置換した。最近のEV-D68発生におけるOntaro(n=2)とUSA(n=21)からの株のWGS間の密接な相同性は,遺伝的関連性と発生のための一般的なソースを示唆する。EV-D68と2014年のEV-D68発生株の最も最近の一般的祖先の時間は,ウイルスがそれぞれ1960~1961年と2012~2013年の間に出現したことを示唆している。著者らは,部分的VP1遺伝子配列で推定されるよりもWGSデータを用いて,グローバルEV-D68のより低い平均進化率を観察した。WGSデータに基づいて,EV-D68B2bクラスタの進化の推定平均速度は9.75×10~3置換/サイト/年(95%BCI4.11×10~3~16×10~3)であった。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 日本 ,  病原体 ,  系統発生 ,  感染 ,  オランダ王国 ,  *ウイルス ,  系統樹 ,  クラスタ ,  呼吸器疾患 ,  相同性 ,  遺伝子
準シソーラス用語： 遺伝子配列 ,  クレード ,  ゲノム配列 ,  遺伝子タイピング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： エンテロウイルスD68 ,  系統発生解析 ,  全ゲノム配列決定 ,  クラスター系列 ,  次世代シークエンシング ,  発生

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (6件)： カナダ ,  オンタリオ州 ,  エンテロウイルスD68 ,  球 ,  分布 ,  進化史