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J-GLOBAL ID：201802254794082100   整理番号：18A0974275

トランスクリプトーム統合によるヒト髄膜腫におけるmiRNA-mRNAの同時分析:PTX3とmiR-29Cの間の関係【JST・京大機械翻訳】

Simultaneous analysis of miRNA-mRNA in human meningiomas by integrating transcriptome: A relationship between PTX3 and miR-29c

著者 (11件)： Dalan Altay Burak (Department of Biochemistry, Yeditepe University Medical School, Istanbul, Turkey) ,  Gulluoglu Sukru (Department of Medical Genetics, Yeditepe University Medical School, Istanbul, Turkey) ,  Gulluoglu Sukru (Department of Biotechnology, Institute of Science, Yeditepe University, Istanbul, Turkey) ,  Tuysuz Emre Can (Department of Medical Genetics, Yeditepe University Medical School, Istanbul, Turkey) ,  Tuysuz Emre Can (Department of Biotechnology, Institute of Science, Yeditepe University, Istanbul, Turkey) ,  Kuskucu Aysegul (Department of Medical Genetics, Yeditepe University Medical School, Istanbul, Turkey) ,  Yaltirik Cumhur Kaan (Department of Neurosurgery, Yeditepe University Medical School, Istanbul, Turkey) ,  Ozturk Oguz (Department of Molecular Medicine, Capa School of Medicine, Istanbul University, Istanbul, Turkey) ,  Ture Ugur (Department of Neurosurgery, Yeditepe University Medical School, Istanbul, Turkey) ,  Bayrak Omer Faruk (Department of Medical Genetics, Yeditepe University Medical School, Istanbul, Turkey) ,  Bayrak Omer Faruk (Yeditepe Universitesi Hastanesi Genetik Tani Merkezi, Istanbul, Turkey)
資料名： BMC Cancer (Web)  (BMC Cancer (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 207  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7305A  ISSN： 1471-2407  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:髄膜腫は一般的な疾患であるが,その開始と進行の背後にある分子機構の理解が不足している。髄膜腫における調節不全遺伝子とネットワークを発見するために,miRNA-mRNAトランスクリプトーム解析を併用した。【方法】14の新鮮凍結髄膜腫サンプルと1つのヒト髄膜細胞株を,miRNAと全トランスクリプトームマイクロアレイチップを用いて分析した。データを濾過し,分析した。候補miRNAとmRNAは,58人の患者サンプルで検証のために選択された。miRNAと標的mRNA関係は,髄膜腫細胞でmiRNAを阻害することによって評価した。アポトーシスと生存性アッセイも機能試験として用いた。【結果】全トランスクリプトームマイクロアレイを用いて,3753の遺伝子が調節不全であることがわかり,891のmiRNAがmiRNAマイクロアレイの結果として調節されていることがわかった。結果は,バイオインフォマティクスツールによって結合して分析した。上部差動経路は,炎症,癌および細胞増殖および生存のそれらを含んだ。癌抑制剤PTX3は髄膜腫試料で構成的に低かった。さらに,PTX3は著者らの試料においてmiR-29cと負に相関した。miR-29cの阻害は,PTX3レベルを上方制御し,髄膜腫細胞のアポトーシスを誘導し,細胞生存率を低下させた。Cabin1,miR-29c,Tmod1,PTX3,RPL22,SPARCL1およびRELAは,患者サンプルにおける臨床病理学的特徴と相関していた。【結論】著者らの結果は,髄膜腫における最初の統合mRNA-miRNA分析を提示する。miR-29c-3pおよびPTX3は,組織および髄膜腫細胞において逆相関し,PTX3がmiR-29c-3pにより調節されることを示唆した。さらに,潜在的な臨床病理学的マーカーを決定した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細胞増殖 ,  *髄膜 ,  遺伝子 ,  アップレギュレーション ,  *髄膜腫 ,  ネットワーク ,  患者 ,  炎症 ,  *ヒト ,  アポトーシス ,  *トランスクリプトーム ,  *mRNA
準シソーラス用語： マイクロアレイ ,  *ペントラキシン3 ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 髄膜腫 ,  マイクロアレイ ,  miRNA ,  トランスクリプトーム ,  PTX3 ,  miR-29c

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (24件)：

• Neurol Med Chir (Tokyo); Pathology and Molecular Genetics of Meningioma: Recent Advances; M Shibuya; 55; Suppl 1; 2015; 14-27; 10.2176/nmc.ra.2014-0233; CR1;
• Oncogene; Identification of a progenitor cell of origin capable of generating diverse meningioma histological subtypes; M Kalamarides, AO Stemmer-Rachamimov, M Niwa-Kawakita, F Chareyre, E Taranchon, ZY Han, C Martinelli, EA Lusis, B Hegedus, DH Gutmann; 30; 20; 2011; 2333-2344; 10.1038/onc.2010.609; CR2;
• Lancet Neurol; Histological classification and molecular genetics of meningiomas; MJ Riemenschneider, A Perry, G Reifenberger; 5; 12; 2006; 1045-1054; 10.1016/S1474-4422(06)70625-1; CR3;
• Nucleic Acids Res; Gene Expression Omnibus: NCBI gene expression and hybridization array data repository; R Edgar, M Domrachev, AE Lash; 30; 1; 2002; 207-210; 10.1093/nar/30.1.207; CR4;
• J Neurosurg; Genomic landscape of intracranial meningiomas; WL Bi, M Abedalthagafi, P Horowitz, PK Agarwalla, Y Mei, AA Aizer, R Brewster, GP Dunn, O Al-Mefty, BM Alexander; 125; 3; 2016; 525-535; 10.3171/2015.6.JNS15591; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： トランスクリプトーム ,  統合 ,  ヒト ,  髄膜腫 ,  miRNA ,  mRNA ,  同時分析 ,  PTX3