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J-GLOBAL ID：201802254936500549   整理番号：18A1940263

計算系統力学における最近の進歩【JST・京大機械翻訳】

Recent advances in computational phylodynamics

著者 (8件)： Baele Guy (KU Leuven Department of Microbiology and Immunology, Rega Institute, Laboratory of Evolutionary and Computational Virology, Leuven, Belgium) ,  Dellicour Simon (KU Leuven Department of Microbiology and Immunology, Rega Institute, Laboratory of Evolutionary and Computational Virology, Leuven, Belgium) ,  Dellicour Simon (Spatial Epidemiology Lab (SpELL), Universite Libre de Bruxelles, Bruxelles, Belgium) ,  Suchard Marc A (Department of Biomathematics, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, CA, USA) ,  Suchard Marc A (Department of Biostatistics, Fielding School of Public Health, University of California, Los Angeles, CA, USA) ,  Suchard Marc A (Department of Human Genetics, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, CA, USA) ,  Lemey Philippe (KU Leuven Department of Microbiology and Immunology, Rega Institute, Laboratory of Evolutionary and Computational Virology, Leuven, Belgium) ,  Vrancken Bram (KU Leuven Department of Microbiology and Immunology, Rega Institute, Laboratory of Evolutionary and Computational Virology, Leuven, Belgium)
資料名： Current Opinion in Virology  (Current Opinion in Virology)
巻： 31  ページ： 24-32  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3142A  ISSN： 1879-6257  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウイルスゲノムデータから構築されたタイムスタンプ,トレットアノテーション系統樹は,発生中の流行を調査し,監視するためにますます使用されている。これは,ウイルス伝播のパターンと運転者を明らかにするのを助けるために,大規模なデータセットから空間的および人口統計学的プロセスを再構成することを含んでいる。しかし,このような系統学的推論は,データの大きさが増加するにつれて非常に時間がかかり,この複雑さに取り組むことを目的とする無数のアプローチをもたらす。系統学の分野における最先端の現状を解明するために,Bayes推論と付随するソフトウェアにおける最近の発展について議論し,計算効率と関連する可視化ツールを改善するための方法を強調した。完全Bayesアプローチの代替として,統計的コヒーレンスとターンオーバ時間の間を妥協する条件付きソフトウェアパイプラインに触れ,利用可能なソフトウェアパッケージを強調した。最終的に,著者らは,近いリアルタイムにおける流行の大規模な追跡を容易にする可能性がある将来の方向を概説する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 系統樹 ,  *ソフトウェア ,  プログラムパッケージ ,  再構成 ,  コヒーレンス ,  ターンオーバー ,  Bayes推定
準シソーラス用語： 実時間 ,  可視化ツール ,  計算効率 ,  最先端 ,  系統学 ,  ウイルス伝播 ,  タイムスタンプ ,  ウイルスゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 計算 ,  系統 ,  力学