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J-GLOBAL ID：201802255144993873   整理番号：18A1991924

全EBウイルスゲノムに沿った組換え速度は高度に不均一な景観を示す【JST・京大機械翻訳】

Recombination rates along the entire Epstein Barr virus genome display a highly heterogeneous landscape

著者 (3件)： Berenstein Ariel Jose (Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologias Pediatricas (IMIPP), CONICET-GCBA, Laboratorio de Biologia Molecular, Division Patologia, Hospital de Ninos Ricardo Gutierrez, Buenos Aires, Argentina) ,  Lorenzetti Mario Alejandro (Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologias Pediatricas (IMIPP), CONICET-GCBA, Laboratorio de Biologia Molecular, Division Patologia, Hospital de Ninos Ricardo Gutierrez, Buenos Aires, Argentina) ,  Preciado Maria Victoria (Instituto Multidisciplinario de Investigaciones en Patologias Pediatricas (IMIPP), CONICET-GCBA, Laboratorio de Biologia Molecular, Division Patologia, Hospital de Ninos Ricardo Gutierrez, Buenos Aires, Argentina)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 65  ページ： 96-103  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Epstein Barrウイルス(EBV)は安定であると想定されている大きなDNAゲノムを有するが,ヌクレオチド置換や組換えなどの突然変異過程にもさらされており,後者はより少ない範囲で探索されている。さらに,ヘルペスサブファミリーにわたる再結合イベントの程度の違いが最近報告された。ウイルス進化における組換えの関連性と病因におけるその可能な影響を考えて,著者らは,グローバルおよび局所的再結合率値(ρ/bp)を評価することによって,すべての利用可能なEBV完全ゲノムにおけるその拡張を完全に特性化し定量化することを目的とした。著者らの結果は,全ゲノムに対する平均値が0.035(HPDI 0.020-0.062)ρ/bpである遺伝子レベルによる全体および遺伝子の両方において,組換え率評価に基づく最初のEBV組換えマップを提供する。著者らは,この進化過程がEBVゲノムに沿ってどのように変化するかを定量化し,調節領域が最も低い再結合速度値を示し,一方反復領域が最も高いシグナルを示すので,それが不均一であることを証明した。さらに,GC含量に富む領域は,以前に報告されたように,高い再結合速度とは関連していないように思われる。遺伝子内レベルにおいて,4つの遺伝子(EBNA3C,EBNA3B,BRRF2およびBBLF2-BBLF3)は,ゲノム平均以上の組換え率を示した。異なる組換え開始剤の間のシグナル強度を特異的に定量し,ρ/bp,TGGAG及びCCCAGの最大量の変化を誘導するそれらが真核細胞におけるモチーフを誘導する2つの良く特性化された組換えであると結論した。著しいことに,TGGAGはEBVゲノム(697ヒット)を通して最も頻繁に検出されたDNAモチーフではなかったが,他のより代表的なモチーフ,p値=0.04よりも有意に大きな割合の開始事象(0.025イベント/ヒット)を誘導した。1つの尾部比率試験。現在の結果は,ヘルペスウイルスの多様性と進化が,点突然変異の通常の考慮を超えて拡張する組換えのような機構により影響されるという考えを支持する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 再結合 ,  DNA【核酸】 ,  調節遺伝子 ,  病因 ,  遺伝子 ,  水疱 ,  真核細胞 ,  ヌクレオチド ,  *EBウイルス ,  点突然変異 ,  キャラクタリゼーション ,  突然変異 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： ヘルペスウイルス ,  p値 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： EBVゲノム ,  EBV組換え ,  再結合速度 ,  組換えモチーフ

分類 (3件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： EBウイルス ,  ゲノム ,  組換え ,  景観