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J-GLOBAL ID：201802255336731774   整理番号：18A0620106

塩分ストレス下のLycopersicum esculentumの葉,unravels揮発性物質放出と遺伝子発現の転写プロファイル解析【Powered by NICT】

Transcription profile analysis of Lycopersicum esculentum leaves, unravels volatile emissions and gene expression under salinity stress

著者 (5件)： Zhang Jihong (Department of Chemical Engineering, Xiangtan University, Xiangtan 411105, China) ,  Zeng Li (Department of Chemical Engineering, Xiangtan University, Xiangtan 411105, China) ,  Chen Shaoyang (Department of Chemical Engineering, Xiangtan University, Xiangtan 411105, China) ,  Sun Helong (Department of Chemical Engineering, Xiangtan University, Xiangtan 411105, China) ,  Ma Shuang (Department of Chemical Engineering, Xiangtan University, Xiangtan 411105, China)
資料名： Plant Physiology and Biochemistry  (Plant Physiology and Biochemistry)
巻： 126  ページ： 11-21  発行年： 2018年 
JST資料番号： W1643A  ISSN： 0981-9428  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： フランス (FRA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 塩分ストレスは発生と植物成長を妨げる悪影響。しかし,NaCl耐性にほとんど分子情報とLycopersicum esculentumにおける揮発性物質放出である。揮発性化合物の放出に及ぼす塩分ストレスの影響を調べるために,著者らは連続塩分ストレスに曝露した後の固相ミクロ抽出(SPME)と組み合わせたガスクロマトグラフィー/質量分析(GC/MS)を用いたRNA-Seq解析と揮発性成分によるトランスクリプトーム変化を定量化し,比較した。GC-MS分析による化学分析は,NaClストレスは放出された揮発性化合物の種類と量を変化したことを明らかにした。本研究では,44,714個の組み立てたユニークな転写産物を代表する21,578のunigeneがde novoトランスクリプトーム集合に基づくNaClストレスに曝露したトマト葉から分離した。差次的に発現した遺伝子の総数はNaClに暴露した後の7210であり,6200がダウンレギュレートし,1208のアップレギュレートされた遺伝子を含む。これらの差次的に発現した遺伝子(DEGs)の中で,揮発性物質生合成と関連した十八個の差次的に発現した遺伝子であった。ユニジーンのうち,3454名は131KEGG(Kyoto Encyclopediaof Genes and Genomes)経路にマッピングされた,主にはRNA輸送,植物-病原体相互作用,および植物ホルモンシグナル伝達に関与している。qRT PCR分析は,NaCl曝露は八種の揮発性化合物(IPI,GPS,TPS,など),RNA-Seq分析とGC-MS結果とよく一致し,生合成遺伝子の発現プロファイルに影響することを示した。著者らの結果は,NaClストレスは,揮発性有機化合物の生合成に関与する遺伝子の発現を調節することによりL.esculentumの葉からの揮発性物質の放出に影響することを示唆する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 植物ホルモン ,  植物成長 ,  *揮発分 ,  RNA【核酸】 ,  質量分析 ,  揮発性有機化合物 ,  *遺伝子 ,  *遺伝子発現 ,  トランスクリプトーム ,  *揮発性 ,  生合成 ,  *トマト ,  塩化ナトリウム
準シソーラス用語： 転写産物 ,  *塩分ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Lycopersicum esculentum ,  塩分ストレス ,  トランスクリプトーム ,  揮発性放出 ,  GC-MS

分類 (2件)： 植物生理学一般  (EH02010Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 塩分ストレス ,  葉 ,  揮発性物質 ,  放出 ,  遺伝子発現 ,  転写プロファイル ,  解析