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J-GLOBAL ID：201802255406105513   整理番号：18A0965585

中期水不足は対照的な環境起源のユーカリ種における異なるトランスクリプトーム応答を誘発する【JST・京大機械翻訳】

Medium term water deficit elicits distinct transcriptome responses in Eucalyptus species of contrasting environmental origin

著者 (6件)： Spokevicius Antanas V. (School of Ecosystem and Forest Sciences, University of Melbourne, Creswick, Australia) ,  Tibbits Josquin (Victorian AgriBiosciences Centre, La Trobe University R&D Park, Bundoora, Australia) ,  Rigault Philippe (GYDLE, Quebec, Canada) ,  Nolin Marc-Alexandre (GYDLE, Quebec, Canada) ,  Mueller Caroline (Faculty of Agriculture and the Environment, The University of Sydney, Sydney, Australia) ,  Merchant Andrew (Faculty of Agriculture and the Environment, The University of Sydney, Sydney, Australia)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 284  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】地質学的時間スケールにわたる気候学的および編集的条件は,ユーカリ属(L.属)の中で適応形質と高い種分化の膨大な多様性を生み出した。患者。ユーカリ種は高い降雨から半乾燥地帯へ,そして熱帯から緯度へ43°Sの高さで発生する。いくつかの形態学的および代謝的特性化にもかかわらず,環境変化に対する耐性の差を支える遺伝子発現の差異に関してはほとんど知られていない。対照的分類学,形態学および生理学(E.globulusおよびE.cloadocalix)の種を用いて,本研究は,中期水制限に対するユーカリ応答に関与する重要な遺伝子を同定するために,生理学的特性化を第二世代配列決定と組み合わせた。【結果】水欠乏処理または十分な水管理を受けた植物の14の組織試料から120の高品質HiSeq readsを作成した。E.grandisゲノムに対するアラインメントは,処理に応答して1つまたは2つの生態型において異なる発現(FDR<0.01)を示した。更なる分析により,これらの遺伝子のうちの23が特性化されていない「乾燥」種E.cladocalixに対して74が結合している有意な種特異的応答を示す80の遺伝子を同定した。これらの差次的に発現した遺伝子の大部分(約80%)は,幹組織で発現した。種の応答を区別する重要な遺伝子は,植物代謝経路ネットワーク分析に基づいて,光保護/酸化還元バランス,植物ホルモン/シグナル伝達,一次光合成/細胞代謝および二次代謝と関連していた。【結論】これらの結果は,「乾燥」気候ユーカリ,特に幹組織における水欠乏に対するより明確な応答を強調し,「湿潤」と「乾燥」気候ユーカリの間の差異の原因となる重要な経路と関連遺伝子を同定する。この知識は,将来の気候シナリオの下での樹木改良プログラムと同様に,自然個体群の管理におけるゲノム努力を支援する,この重要な環境応答に関連する機構と遺伝的変異をさらに研究し理解する機会を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： キャラクタリゼーション ,  気候 ,  遺伝子 ,  植物ホルモン ,  *トランスクリプトーム ,  遺伝子発現 ,  モルフォロジー ,  代謝経路 ,  代謝 ,  生理学 ,  個体群 ,  *ユーカリ ,  熱帯 ,  ゲノム
準シソーラス用語： 環境変化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ユーカリ ,  トランスクリプトーム ,  水不足 ,  ホメオスタシス ,  エコタイプ

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (59件)：

• Distribution of eucalypts in Australian landscapes: landforms, soils, fire and nutrition; Nutrition of Eucalypts; MA Adams; CSIRO; 1996; 61-76; CR1;
• Plant Cell Environ; Salt tolerance in Eucalyptus spp.: identity and response of putative osmolytes; MA Adams, A Richter, AK Hill, TD Colmer; 28; 2005; 772-87; 10.1111/j.1365-3040.2005.01328.x; CR2;
• Nat Protoc; Count-based differential expression analysis of RNA sequencing data using R and Bioconductor; S Anders, DJ McCarthy, Y Chen, M Okoniewski, GK Smyth, W Huber, MD Robinson; 8; 2013; 1765-86; 10.1038/nprot.2013.099; CR3;
• Plant Cell Environ; Quercitol and osmotic adaptation of field grown Eucalyptus under seasonal drought stress; SK Arndt, S Livesley, A Merchant, T Bleby, P Grierson; 31; 2008; 915-24; 10.1111/j.1365-3040.2008.01803.x; CR4;
• Eucalypt ecophysiology; Eucalypt ecology; DT Bell, JE Williams; Cambridge University Press; 1997; CR5;

タイトルに関連する用語 (9件)： 中期 ,  水不足 ,  対照 ,  環境 ,  起源 ,  ユーカリ ,  トランスクリプトーム ,  応答 ,  誘発