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J-GLOBAL ID：201802255425301604   整理番号：18A0975659

膠芽腫U87細胞株の遺伝子発現プロファイル分析によるPHF20と潜在的に関連する遺伝子と経路の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of genes and pathways potentially related to PHF20 by gene expression profile analysis of glioblastoma U87 cell line

著者 (14件)： Liu Tianlong (Department of Pharmacy, Xijing Hospital, Fourth Military Medical University, Xi’an, China) ,  Zhang Tiejun (Department of Neurosurgery, The First Affiliated Hospital of SooChow University, Suzhou, China) ,  Zhou Feng (Department of Neurosurgery, The First Affiliated Hospital of SooChow University, Suzhou, China) ,  Wang Jitao (Department of Pharmacy, The First Affiliated Hospital of SooChow University, Suzhou, China) ,  Zhai Xiaohu (Department of Pharmacy, Xijing Hospital, Fourth Military Medical University, Xi’an, China) ,  Mu Nan (State Key Laboratory of Cancer Biology, Department of Biopharmaceutics, School of Pharmacy, Fourth Military Medical University, Xi’an, China) ,  Park Jongsun (Department of Pharmacology, Chungnam National University, Daejon, South Korea) ,  Liu Minna (Department of Nephrology, Xijing Hospital, Fourth Military Medical University, Xi’an, China) ,  Liu Wenxing (Department of Pharmacy, Xijing Hospital, Fourth Military Medical University, Xi’an, China) ,  Shang Peijin (Department of Pharmacy, Xijing Hospital, Fourth Military Medical University, Xi’an, China) ,  Ding Yi (Department of Pharmacy, Xijing Hospital, Fourth Military Medical University, Xi’an, China) ,  Wen Aidong (Department of Pharmacy, Xijing Hospital, Fourth Military Medical University, Xi’an, China) ,  Li Yuwen (Department of Pharmacy, Xijing Hospital, Fourth Military Medical University, Xi’an, China) ,  Li Yuwen (Department of Pharmacy, The First Affiliated Hospital of SooChow University, Suzhou, China)
資料名： Cancer Cell International (Web)  (Cancer Cell International (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 87  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7315A  ISSN： 1475-2867  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】膠芽腫は,予後不良に関連する最も一般的で攻撃的な脳腫瘍である。植物ホメオドメインフィンガー蛋白質20(PHF20)は一次ヒト神経膠腫で高度に発現し,その発現は腫瘍グレードと関連する。しかし,PHF20がグリア芽細胞腫を調節する分子機構はほとんど理解されていない。【方法】ゲノムワイド遺伝子発現分析を行い,PHF20遺伝子ノックダウンによりU87細胞における差次的発現遺伝子(DEG)を同定した。遺伝子オントロジー(GO)と経路濃縮分析を行い,DEGの機能と経路を調べた。Pathway-netおよびシグナル-ネット分析を行い,PHF20に関連する重要な遺伝子および経路を同定した。結果:FEN1とCCL3を含む540の遺伝子の発現は,PHF20遺伝子サイレンシングにより有意に変化した。GO分析結果は,DEGが小分子代謝およびアポトーシス過程において有意に濃縮されていることを示した。経路分析は,DEGが主に癌と代謝経路に関与していることを示した。MAPK,アポトーシス及びp53シグナル伝達経路は経路ネットワークにおけるハブ経路として同定されたが,Plcb1,NRAS及びPIK3はシグナル伝達ネットワークにおけるハブ遺伝子であった。結論:著者らの所見は,PHF20が重要な上流調節因子であることを示した。これは,FEN1,CCL3,Plcb1,NRASおよびPIK3のような一連の腫瘍関連遺伝子を調節することにより,およびアポトーシスシグナル伝達経路の活性化を調節することにより,グリオーマの発生および発生に影響を及ぼす。従って,PHF20は早期診断のための新しいバイオマーカーであり,グリア芽細胞腫治療の潜在的標的である可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヒト ,  バイオマーカー ,  脳腫瘍 ,  *膠芽腫 ,  遺伝子サイレンシング ,  *遺伝子 ,  代謝経路 ,  ネットワーク ,  *遺伝子発現 ,  p53タンパク質 ,  アポトーシス ,  代謝 ,  MAPキナーゼ
準シソーラス用語： *遺伝子発現プロファイリング ,  *U87細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： PHF20 ,  神経膠芽腫 ,  U87細胞 ,  遺伝子発現プロファイル ,  バイオインフォマティクス

分類 (2件)： 抗腫よう薬の基礎研究  (GW16010A) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (38件)：

• N Engl J Med; Malignant gliomas in adults; YW Patrick, K Santosh; 359; 2008; 492-507; 10.1056/NEJMra0708126; CR1;
• JAMA; Glioblastoma and other malignant gliomas: a clinical review; A Omuro, LM DeAngelis; 310; 17; 2013; 1842-1850; 10.1001/jama.2013.280319; CR2;
• Neuro-Oncology.; CBTRUS statistical report: primary brain and central nervous system tumors diagnosed in the United States in 2008-2012; QT Ostrom, H Gittleman, J Fulop, M Liu, R Blanda, C Kromer, Y Wolinsky, C Kruchko, JS Barnholtz-Sloan; 17; suppl 4; 2015; v1-v62; 10.1093/neuonc/nov189; CR3;
• J Biol Chem; Loss of the methyl lysine effector protein PHF20 impacts the expression of genes regulated by the lysine acetyltransferase MOF; AI Badeaux, Y Yang, K Cardenas, V Vemulapalli, K Chen, D Kusewitt, E Richie, W Li, MT Bedford; 287; 1; 2011; 429-437; 10.1074/jbc.M111.271163; CR4;
• Cell Signal; PKB-mediated PHF20 phosphorylation on Ser291 is required for p53 function in DNA damage; Y Li, J Park, L Piao, G Kong, Y Kim, KA Park, T Zhang, J Hong, GM Hur, JH Seok; 25; 1; 2013; 74-84; 10.1016/j.cellsig.2012.09.009; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： 膠芽腫 ,  U87細胞 ,  株 ,  遺伝子発現プロファイル ,  分析 ,  遺伝子 ,  経路 ,  同定