文献

J-GLOBAL ID：201802255479759403   整理番号：18A0965671

Gossypium hirsutumにおけるスーパーオキシドジスムターゼ(SOD)遺伝子のゲノムワイド特性化と発現解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide characterization and expression analyses of superoxide dismutase ( SOD ) genes in Gossypium hirsutum

著者 (5件)： Wang Wei (State Key Laboratory of Crop Biology, College of Agronomy, Shandong Agricultural University, Tai’an, People’s Republic of China) ,  Zhang Xiaopei (State Key Laboratory of Crop Biology, College of Agronomy, Shandong Agricultural University, Tai’an, People’s Republic of China) ,  Deng Fenni (State Key Laboratory of Crop Biology, College of Agronomy, Shandong Agricultural University, Tai’an, People’s Republic of China) ,  Yuan Rui (State Key Laboratory of Crop Biology, College of Agronomy, Shandong Agricultural University, Tai’an, People’s Republic of China) ,  Shen Fafu (State Key Laboratory of Crop Biology, College of Agronomy, Shandong Agricultural University, Tai’an, People’s Republic of China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 376  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:スーパーオキシドジスムターゼ(SOD)は重要な抗酸化酵素ファミリーであり,活性酸素種の毒性作用に対する植物の保護に関与している。現在の研究は,遺伝子ファミリーが植物成長と発生過程および生物的および非生物的ストレス応答に関与していることを示しているが,高地ワタにおけるその機能的役割についてはほとんど知られていない。【結果】本研究において,高地ワタ(Gossypium hirsutum)におけるSOD遺伝子ファミリーの特性を包括的に分析した。それらの保存されたモチーフに基づいて,18のGhSOD遺伝子を同定し,系統発生的に5つのサブグループに分類し,遺伝子構造パターンと細胞内局在に基づく分類を確証した。GhSOD配列は,26の染色体のうちの12を通して異なる密度で分布した。保存されたドメイン,プロモーター領域の遺伝子ファミリー進化シス作用要素およびmiRNA仲介転写後調節を予測し,分析した。加えて,18のGhSOD遺伝子の発現パターンを,異なる組織/器官および発育段階,および異なる非生物的ストレスおよびアブシシン酸で試験した。それはSOD遺伝子ファミリーが一時的および空間特異性発現特異性を有し,高地ワタにおける様々なストレスによって引き起こされた活性酸素種捕捉において重要な役割を果たす可能性があることを示した。【結論】本研究は,高地ワタSOD遺伝子ファミリーの最初の全ゲノム解析を記述し,結果は,ストレス応答の間のGhSOD遺伝子ファミリーのさらなるクローニングと機能的検証のための基礎を確立し,作物の改善をもたらす。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 染色体 ,  活性酸素 ,  高地 ,  毒性 ,  *遺伝子 ,  *スーパーオキシドジスムターゼ ,  植物成長 ,  プロモーター領域 ,  成長段階 ,  *キャラクタリゼーション ,  系統発生
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  マイクロRNA ,  非生物的ストレス ,  遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： SOD ,  高地の綿 ,  ゲノムワイド解析 ,  非生物的ストレス ,  発現プロファイル

分類 (4件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  繊維料作物  (FC03077U)

引用文献 (104件)：

• Plant Physiol; Toward sequencing cotton (Gossypium) genomes; ZJ Chen, BE Scheffler, E Dennis, BA Triplett, T Zhang, W Guo, X Chen, DM Stelly, PD Rabinowicz, CD Town; 145; 4; 2007; 1303-10; 10.1104/pp.107.107672; CR1;
• Genet Mol Biol; Modeling and analysis of soybean (Glycine max. L) Cu/Zn, Mn and Fe superoxide dismutases; VR Gopavajhula, KV Chaitanya, P Akbar Ali Khan, JP Shaik, PN Reddy, M Alanazi; 36; 2; 2013; 225-36; 10.1590/S1415-47572013005000023; CR2;
• Biochem Mosc; Gene expression characteristics and regulation mechanisms of superoxide dismutase and its physiological roles in plants under stress; W Wang, MX Xia, J Chen, R Yuan, FN Deng, FF Shen; 81; 5; 2016; 465-80; 10.1134/S0006297916050047; CR3;
• Mol Breed; Superoxide dismutase multigene family in longan somatic embryos: a comparison of CuZn-SOD, Fe-SOD, and Mn-SOD gene structure, splicing, phylogeny, and expression; Y-L Lin, Z-X Lai; 32; 3; 2013; 595-615; 10.1007/s11032-013-9892-2; CR4;
• PLoS One; The Populus superoxide dismutase gene family and its responses to drought stress in transgenic poplar overexpressing a pine cytosolic glutamine synthetase (GS1a); JJ Molina-Rueda, CJ Tsai, EG Kirby; 8; 2; 2013; e56421; 10.1371/journal.pone.0056421; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： Gossypium ,  スーパーオキシドジスムターゼ ,  SOD ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  特性化 ,  発現解析