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J-GLOBAL ID：201802255535595983   整理番号：18A0278195

Perkinsus olseni感染に応答したアサリ(Ruditapes philippinarum)血球のトランスクリプトームプロファイル【Powered by NICT】

Transcriptomic profile of Manila clam (Ruditapes philippinarum) haemocytes in response to Perkinsus olseni infection

著者 (12件)： Hasanuzzaman Abul Farah Md. (Departamento de Xenetica, Facultade de Veterinaria, Universidade de Santiago de Compostela, Lugo, 27002, Spain) ,  Hasanuzzaman Abul Farah Md. (Fisheries and Marine Resource Technology Discipline, Khulna University, Khulna, 9208, Bangladesh) ,  Robledo Diego (Departamento de Xenetica, Facultade de Bioloxia, Universidade de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, 15782, Spain) ,  Gomez-Tato Antonio (Departamento de Xeometria e Topoloxia, Facultade de Matematicas, Universidade de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, 15782, Spain) ,  Alvarez Dios Jose A. (Departamento de Matematica Aplicada, Facultade de Matematicas, Universidade de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, 15782, Spain) ,  Harrison Peter W. (Department of Genetics, Evolution and Environment, University College London, London, WC1E 6BT, United Kingdom) ,  Cao Asuncion (Centro de Investigacions Marinas (CIMA), Conselleria do Medio Rural e do Mar, Xunta de Galicia, 36620, Vilanova de Arousa, Spain) ,  Fernandez-Boo Sergio (Centro de Investigacions Marinas (CIMA), Conselleria do Medio Rural e do Mar, Xunta de Galicia, 36620, Vilanova de Arousa, Spain) ,  Villalba Antonio (Centro de Investigacions Marinas (CIMA), Conselleria do Medio Rural e do Mar, Xunta de Galicia, 36620, Vilanova de Arousa, Spain) ,  Villalba Antonio (Departamento de Ciencias de la Vida, Universidad de Alcala, 28871, Alcala de Henares, Spain) ,  Pardo Belen G. (Departamento de Xenetica, Facultade de Veterinaria, Universidade de Santiago de Compostela, Lugo, 27002, Spain) ,  Martinez Paulino (Departamento de Xenetica, Facultade de Veterinaria, Universidade de Santiago de Compostela, Lugo, 27002, Spain)
資料名： Aquaculture  (Aquaculture)
巻： 467  ページ： 170-181  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0784A  ISSN： 0044-8486  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 地球軟体動物生産への主要な寄与因子の1つであるRuditapes philippinarumがperkinsosis,原生動物Perkinsus olseni(アルベオラータ,Perkinsidae)によって引き起こされる疾患の影響を受けやすい。この寄生虫に対するアサリ防御細胞(血球)の分子応答はこの病害を防除するへの頭部に必須である。ここで著者らは,RNA-seqを用いた野生および実験条件(in vivoおよびin vitro)から集めた健常とP.olseni感染二枚貝からアサリ血球トランスクリプトームを構築した。アサリde novoトランスクリプトームは33,079転写物,そのうちの7300はNCBI非冗長(NR)蛋白質データベースと有意に注釈した(E値<1.0e5)から構成されている。これらの注釈付き転写物の中で,多くはシグナル伝達,細胞増殖,細胞接着,免疫系(例えば,免疫応答,免疫エフェクタープロセス,抗原処理)とストレスと刺激に対する応答に機能的に関連している。著者らの研究は,本資料でR.philippinarum血球の以前のトランスクリプトーム情報,異なる感染シナリオにおけるP.olseni感染後に発現アノテーション記述を注目すべき量の新しい転写物を含む,それらの多くのストレス関連プロセスに関連したを統合している。差次的に発現した遺伝子(DEGs)の予備的分析は,同様の実験条件下で得られた制御後に攻撃感染した血球のプール試料からの配列を用いて行った。より多くのDEGをin vivoよりもin vitroで刺激した血球で検出され,P.olseni栄養,遊走子と菌体外生成物を有するより急性およびin vitroで異なる挑戦を示した。in vitroでほとんどDEGはダウンレギュレーションと関連する免疫及びストレス応答と,感染の開始時に起こる免疫抑制を反映すると思われたが,in vivo感染血球におけるDEGは主に代謝過程に関連していた。血球応答に関する予備的DEG解析はperkinsosisに対するアサリ防御細胞の分子機構にいくつかの洞察を提供する。高アサリ死亡率はPerkinsus olseniによるperkinsosisのために報告されているが,perkinsosisに対するRuditapes philippinarum応答の分子機構はまだ十分解明されていない。著者らの研究は,以前の報告とR.philippinarum血球トランスクリプトームデータベースを充実させるための新しいデータを提供し,perkinsosisに対する血球応答に関する予備的情報を提供した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： アノテーション ,  RNA【核酸】 ,  ダウンレギュレーション ,  細胞接着 ,  *トランスクリプトーム ,  細胞増殖 ,  原生動物 ,  遺伝子 ,  *アサリ ,  寄生虫 ,  遺伝子発現 ,  *血球 ,  代謝 ,  *感染
準シソーラス用語： ストレス応答 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： アサリ ,  RNA-seq ,  血球トランスクリプトーム ,  パーキンサス ,  免疫応答 ,  遺伝子発現

分類 (4件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  植物生理学一般  (EH02010Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  汚染原因物質一般  (SB05010P)

タイトルに関連する用語 (5件)： 感染 ,  応答 ,  アサリ ,  Ruditapes ,  血球