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J-GLOBAL ID：201802255620413294   整理番号：18A0724793

DNA内のグルコース-核酸塩基対:疎水性,代替結合単位およびDNAポリメラーゼヌクレオチド挿入研究の影響【JST・京大機械翻訳】

Glucose-nucleobase pairs within DNA: impact of hydrophobicity, alternative linking unit and DNA polymerase nucleotide insertion studies

著者 (13件)： Vengut-Climent Empar (Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, Instituto de Parasitologia y Biomedicina Lopez Neyra, CSIC, PTS Granada, Avda. del Conocimiento, 17, 18016 Armilla, Granada, Spain. [e-mail]) ,  Penalver Pablo ,  Lucas Ricardo ,  Gomez-Pinto Irene ,  Avino Anna ,  Muro-Pastor Alicia M. ,  Galbis Elsa ,  de Paz M. Violante ,  Fonseca Guerra Celia ,  Bickelhaupt F. Matthias ,  Eritja Ramon ,  Gonzalez Carlos ,  Morales Juan Carlos
資料名： Chemical Science (Web)  (Chemical Science (Web))
巻： 9  号： 14  ページ： 3544-3554  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7042A  ISSN： 2041-6539  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近,アミノグリコシド-RNA認識で見出される結合モチーフであるグルコース-核酸塩基対を研究した。核酸塩基としてグルコースを有するDNA二本鎖は,ハイブリッド化でき,プリンに対して選択的であった。それらは天然DNAよりも安定性が低かったが,通常のB-DNAに良く適合した。これらの結果は,非芳香族DNA塩基模倣体としてのグルコースの利用可能性を開いた。ここでは,異なるタイプの固定ユニットと代替無極性糖-核酸塩基対によるグルコースの取り込みと熱安定性を研究した。より広い固定単位としてグリセロールの代わりにブタントリオールを調べたとき,二重熱安定性を得なかった。この結果は,全体の二重安定性を増加させるために,より立体配座的に制限されたリンカーの必要性を確認した。ペルメチル化グルコース-核酸塩基対は,グルコース-核酸塩基対に類似の安定性を示したが,それらの間の水素結合の不在により,特異的核酸塩基に対する選択性を示さなかった。二本鎖の三次元構造は,グルコース-核酸塩基対の場合と同様に,DNAヘリックス内の疎水性ペルメチル化グルコースと核酸塩基の両方に位置していた。グルコース-核酸塩基対に関する量子化学計算は,OH1またはOH4位置を介したDNA骨格への糖の付着が最も高い結合エネルギーを生じることを示す。さらに,グルコースは,DNAにOH1またはOH4を介して結合したとき,グアニンに対して非常に選択的であった。最後に,糖単位の前にヌクレオチドのDNAポリメラーゼ挿入を調べた。大腸菌からのKF-ポリメラーゼは,AとGの反対のglcと6dglcを挿入したが,低い効率を示したが,顕著な選択性を示した。その効率はDNA配列に依存するが,新しい対を広げることさえできる。対照的に,Bst2.0,SIIIおよびBIOTAQ DNAポリメラーゼは,デオキシリボースの代わりに使用される柔軟なグリセロールリンカーにより,おそらくループアウト機構を示すように見える。Copyright 2018 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *核酸 ,  *疎水性 ,  *DNAポリメラーゼ ,  *DNA【核酸】 ,  *塩基対 ,  *核酸塩基 ,  熱安定性 ,  *ヌクレオチド ,  メチル化 ,  水素結合 ,  立体配座 ,  大腸菌 ,  脂肪族アルコール ,  ポリオール ,  ヘキソース ,  アルドース
準シソーラス用語： リンカ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子化合物  (CE02000C) ,  その他の触媒  (CB06123Z)

物質索引 (2件)： グリセロール ,  グルコース

タイトルに関連する用語 (9件)： DNA ,  グルコース ,  核酸 ,  塩基対 ,  疎水性 ,  代替 ,  DNAポリメラーゼ ,  ヌクレオチド ,  研究