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J-GLOBAL ID:201802256138325346   整理番号:18A1801877

蛍光マイクロサテライト(SSR)マーカーを用いた中国新疆省におけるGasterophilus pecorumの遺伝的多様性と個体群構造の評価【JST・京大機械翻訳】

Evaluation of the genetic diversity and population structure of Gasterophilus pecorum in Xinjiang Province, China, using fluorescent microsatellites (SSR) markers
著者 (10件):
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巻: 261  ページ: 53-58  発行年: 2018年 
JST資料番号: A1194A  ISSN: 0304-4017  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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中国,新疆省におけるPrzewalskiのウマ(Equus ferus przewalskii)から採取した192個体から成るGasterphilus pecorum個体群の遺伝的多様性を,12のマイクロサテライト遺伝子座を用いて評価した。個体群内の遺伝的変動性と個体群間の遺伝的分化を推定した。全部で163の対立遺伝子を検出し,各遺伝子座における対立遺伝子の観察数の平均値は7~19(平均13.5625)であった。期待ヘテロ接合性(He)は0.5933(GP361)から0.9208(GP253)まで変化し,平均0.8426であった。単純配列反復(SSR)マーカーの対立遺伝子(Ne)の有効数は7.1756であり,それは2.4430~11.5214の範囲であった。多型情報量(PIC)は0.5643(GP361)から0.9053(GP253)(平均0.8119)の範囲であった。平均Shannonの情報指数(I)は2.1272であった。遺伝的多様性(Ht,HsおよびGst)およびF-統計(Fis,FitおよびFst)のパラメータを推定した。全体の遺伝子多様性(Ht=0.8798)と平均種間遺伝的多様性(Dst=0.0110)の平均は,G.pecorumが比較的高いレベルの遺伝的変異を持つことを示した。それは主に個体群内であった。Fstが0.0029から0.0950の範囲にあり,個体群間の世代移動体(Nm)の数は,2.3814から85.9745まで変化した。これらの結果は,G.pecorum個体群のヘテロ接合性と遺伝的多様性が非常に高く,遺伝子交換が頻繁であることを示した。相関分析は,対立遺伝子の数と個体群の遺伝的多様性が有意に異なっていないことを示した(p=0.2)。算術平均(UPGMA)クラスタ化分析による非加重Pairグループ法は,0.0671-0.1118の遺伝的類似性を明らかにした。分子分散分析(AMOVA)により,個体群内の変動の割合は小さく(0.67%),G.pecorum個体群の遺伝的変異は主に種内に存在することを示した。個体群遺伝構造の理解は,自然個体群における進化力の作用と相互作用を評価するために重要であるだけでなく,G.pecorumにおける寄生戦略の解明にも役立つ。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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分子遺伝学一般  ,  遺伝子の構造と化学 

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