文献

J-GLOBAL ID：201802256237225856   整理番号：18A0508207

トランスクリプトーム解析はアルビノナマコApostichopus japonicusの異なる色素沈着段階における白皮症の機構への洞察を提供する【Powered by NICT】

Transcriptome analysis provides insights into the mechanism of albinism during different pigmentation stages of the albino sea cucumber Apostichopus japonicus

著者 (14件)： Xing Lili (CAS Key Laboratory of Marine Ecology and Environmental Sciences, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China) ,  Xing Lili (Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China) ,  Xing Lili (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) ,  Sun Lina (CAS Key Laboratory of Marine Ecology and Environmental Sciences, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China) ,  Sun Lina (Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China) ,  Liu Shilin (CAS Key Laboratory of Marine Ecology and Environmental Sciences, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China) ,  Liu Shilin (Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China) ,  Li Xiaoni (CAS Key Laboratory of Marine Ecology and Environmental Sciences, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China) ,  Li Xiaoni (Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China) ,  Li Xiaoni (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) ,  Zhang Libin (CAS Key Laboratory of Marine Ecology and Environmental Sciences, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China) ,  Zhang Libin (Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China) ,  Yang Hongsheng (CAS Key Laboratory of Marine Ecology and Environmental Sciences, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China) ,  Yang Hongsheng (Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China)
資料名： Aquaculture  (Aquaculture)
巻： 486  ページ： 148-160  発行年： 2018年 
JST資料番号： E0784A  ISSN： 0044-8486  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 栄養および医学的特性を持つ,ナマコApostichopus japonicus(Selenka)はアジアの多くの地域で最も価値のある市販海洋種と考えられている。異なる色形態のうち,アルビノナマコは稀であり,消費者に大きな魅力を持っている。ナマコにおける白皮症に寄与する因子の同定は,この形態の培養可能性を改善するための科学的基礎を提供するであろう。本研究では,イルミナ配列決定はアルビノナマコの三色素沈着段階:初期色素沈着段階(Wa),中色素沈着段階(Wb)と後期色素沈着段階(Wc)上で行った。,合計で120,365のunigeneはN50長さ3360bpの作成し,60,224遺伝子は七機能データベース(NR,NT,GO,COG,KEGG,SwissprotとInterpro)から注釈された。添加では,39,285個のSSRが検出され,26,156個の単遺伝子に分布していた。初期色素沈着段階ナマコと比較して,842遺伝子は色素沈着期アルビノナマコの体壁,331アップレギュレート及び511ダウンレギュレート遺伝子を含む異なって発現するものとして同定した。中色素沈着段階におけるナマコと比較して,247遺伝子は後期色素沈着期アルビノナマコの体壁で特異的に発現するとして同定された,67上方調節され,180はダウンレギュレーションされた遺伝子を含んでいた。GOとKEGG解析は可能な差次的に発現した遺伝子,アルビノナマコにおける白皮症形成に関与する「メラニン形成」,「Ras情報伝達経路」,「cAMPシグナル伝達経路」と「上皮開発」を明らかにした。結論として,これらの研究は,多くの候補アルビノに関するおよび色素沈着関連遺伝子とシグナル伝達経路を同定した。さらに,比較分析は異なる色素形成段階のアルビノナマコ体壁から異なって発現された遺伝子を調べた。結果はナマコの白皮症の根底にある機序のさらなる解明に非常に有用であるべきである。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 上皮 ,  データベース ,  形態 ,  *色素沈着 ,  *トランスクリプトーム ,  アップレギュレーション ,  消費者 ,  *マナマコ ,  遺伝子 ,  ダウンレギュレーション ,  培養 ,  *ナマコ ,  *色素
準シソーラス用語： *白皮症 ,  *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： アルビノ海はキュウリ ,  色素沈着段階 ,  トランスクリプトーム ,  白皮症関連遺伝子

分類 (1件)： 植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： トランスクリプトーム解析 ,  アルビノ ,  ナマコ ,  Apostichopus ,  色素沈着 ,  段階 ,  白皮症 ,  洞察