Theobroma cacao L.の生殖質バンクの個体群構造解析により明らかにされたCacao遺伝的多様性のコロンビアの起源【JST・京大機械翻訳】

Osorio-Guarin Jaime A.; Berdugo-Cely Jhon; Coronado Roberto Antonio; Zapata Yeny Patricia; Quintero Constanza; Gallego-Sanchez Gerardo; Yockteng Roxana; Yockteng Roxana

文献

J-GLOBAL ID：201802256464512964 整理番号：18A0807028

Theobroma cacao L.の生殖質バンクの個体群構造解析により明らかにされたCacao遺伝的多様性のコロンビアの起源【JST・京大機械翻訳】

Colombia a Source of Cacao Genetic Diversity As Revealed by the Population Structure Analysis of Germplasm Bank of Theobroma cacao L.

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資料名：
巻： 8 ページ： 1994 発行年： 2017年
JST資料番号： U7094A ISSN： 1664-462X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

種Theobroma cacao L.の豆はカカオとして知られており,チョコレートを生産する原料である。コロンビアカカオは,カカオ世界の生産の5%を代表する微細フレーバーカカオとして分類されている。この種からのコロンビア遺伝資源はex situおよびin situ生殖質バンクで保存されており,T.cacaoは難分解性種子を脱カチオンおよび長期貯蔵に持っている。現在,農業研究(Corpoica)のコロンビア社のT.cacaoの収集は約700の生殖質系統を持っている。著者らは,Corpoicaのカカオ収集の分子解析と,その遺伝的多様性と個体群構造を研究する目的でいくつかの系統の形態学的特性化を行い,カカオの育種計画のための興味深い系統を選択することを目的とした。表現型評価は,18の形態学的形質と4つの生化学的形質に基づいて実行した。形態学的特徴のPCA分析は,7つの成分の全変動の60.6%と4つの成分の生化学的特徴の全変動の100%を説明し,両変数に対する4つのクラスタにおける収集をグループ化した。著者らは,96個の一塩基多型(SNP)分子マーカーを用いて,Corpoicaの生殖質からの565系統と参照集団からの252系統を調査した。cacao Corpoicaの収集の分子パターンを,流体の集積回路を用いたFluidigmプラットフォームにおいて特異的対立遺伝子を増幅して得た。Corpoicaの収集は最も高い遺伝的多様性を示した。参照集団がデータセット(H_E=0.294,H_O=0.261)に含まれたときに減少する,観察されたヘテロ接合性(H_O=0.353)。集団構造解析に基づいて収集を4つのクラスタに分割した。異なるグループからのカカオ系統はいくつかの分類学的一致を示し,それらの地理的起源を反映した。例えば,クリオに分類された系統は1つのグループで明確に区別され,2つの新しいコロンビア遺伝グループを同定した。87のSNPマーカーと22の異なる形態学的/生化学的特徴に基づく多くの対立遺伝子変異を用いて,合計232の系統を持つコア収集をカカオ育種家のための主要な遺伝資源として選択した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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菓子 , し好料作物

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