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J-GLOBAL ID：201802256638418442   整理番号：18A0966110

一卵性双生児の発現データの加重遺伝子共発現ネットワーク分析はBMIに関連する特異的モジュールとハブ遺伝子を同定する【JST・京大機械翻訳】

Weighted gene co-expression network analysis of expression data of monozygotic twins identifies specific modules and hub genes related to BMI

著者 (13件)： Wang Weijing (Department of Epidemiology and Health Statistics, Public Health College, Qingdao University, Qingdao, People’s Republic of China) ,  Jiang Wenjie (Department of Epidemiology and Health Statistics, Public Health College, Qingdao University, Qingdao, People’s Republic of China) ,  Hou Lin (Department of Biochemistry, Medical College, Qingdao University, Qingdao, People’s Republic of China) ,  Duan Haiping (Department of Epidemiology and Health Statistics, Public Health College, Qingdao University, Qingdao, People’s Republic of China) ,  Duan Haiping (Qingdao Municipal Center for Disease Control and Prevention, Qingdao, People’s Republic of China) ,  Wu Yili (Department of Epidemiology and Health Statistics, Public Health College, Qingdao University, Qingdao, People’s Republic of China) ,  Xu Chunsheng (Department of Epidemiology and Health Statistics, Public Health College, Qingdao University, Qingdao, People’s Republic of China) ,  Xu Chunsheng (Qingdao Municipal Center for Disease Control and Prevention, Qingdao, People’s Republic of China) ,  Xu Chunsheng (Qingdao Institute of Preventive Medicine, Qingdao, People’s Republic of China) ,  Tan Qihua (Epidemiology, Biostatistics and Bio-demography, Institute of Public Health, University of Southern Denmark, Odense C, Denmark) ,  Tan Qihua (Human Genetics, Institute of Clinical Research, University of Southern Denmark, Odense C, Denmark) ,  Li Shuxia (Human Genetics, Institute of Clinical Research, University of Southern Denmark, Odense C, Denmark) ,  Zhang Dongfeng (Department of Epidemiology and Health Statistics, Public Health College, Qingdao University, Qingdao, People’s Republic of China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 872  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 肥満の治療管理は挑戦的であり,したがって,肥満発生の基礎となる機構をさらに解明し,新しい診断バイオマーカーと治療標的を同定することが緊急で必要である。ここで著者らは,7つの不一致単接合性双生児の遺伝子発現プロファイルデータに基づいてBMIに関連する有意な遺伝子と特異的モジュールを同定するために,示差遺伝子発現分析と重みづけ遺伝子共発現ネットワーク分析(WGCNA)を行った。差次的遺伝子発現分析において,32の差次的発現遺伝子(DEG)は,それらの同胞と比較して,より高いBMIを有する双生児におけるアップレギュレーションの傾向を有するように見えた。一酸化窒素シンターゼ生合成過程の正の調節のカテゴリー,核へのNF-κB移入の正の調節,ペルオキシダーゼ活性は,KEGGデータベース内のGOデータベースとNF-κBシグナル伝達経路の範囲内で有意に濃縮された。NAMPT,TLR9,PTGS2,HBD,およびPCSK1NのDEGは肥満と関連している可能性がある。WGCNAにおいて,同定された合計20の異なる共発現モジュールの中で,coral1モジュール(68の遺伝子)はBMI(r=0.56,P=0.04)および疾患状態(r=0.56,P=0.04)と最も強い正の相関を有した。ホスホリパーゼ活性の正の調節,高密度リポ蛋白質粒子クリアランス,カイロミクロン残留クリアランス,逆コレステロール輸送,中間密度リポ蛋白質粒子,キロミクロン,低密度リポ蛋白質粒子,超低密度リポ蛋白質粒子,電位依存性カリウムチャンネル複合体,コレステロール輸送体活性,神経ペプチドホルモン活性は,このモジュールのGOデータベース内で有意に濃縮された。そして,アルコール中毒および細胞接着分子経路は,KEGGデータベース内で有意に濃縮された。GAL,ASB9,NPPB,TBX2,IL17C,APOE,ABCG4およびAPOC2のようないくつかのハブ遺伝子も同定された。saddleBrownモジュール(212遺伝子)のモジュール固有遺伝子もBMI(r=0.56,P=0.04)と有意に相関し,KCNN1とAQP10のハブ遺伝子は差別的に発現した。著者らは,単一接合性双生児の遺伝子発現プロファイルデータに基づいて,BMIに潜在的に関連する有意な遺伝子および特異的モジュールを同定した。これらの知見は,肥満発症の根底にある機構をさらに解明し,肥満治療のための潜在的遺伝子バイオマーカーとシグナル伝達経路を研究するための新しい洞察を提供する可能性がある。ここで報告した知見の更なる分析と検証は,より多くの試料サイズを得るときに重要で必要である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子発現 ,  肥満 ,  *双生児 ,  治療法 ,  LDL【リポタンパク質】 ,  複合体 ,  生合成 ,  クリアランス ,  *遺伝子 ,  データベース ,  細胞接着分子 ,  HDL【リポタンパク質】 ,  バイオマーカー ,  アップレギュレーション ,  NFκB

著者キーワード (7件)： BMI ,  異なる発現遺伝子 ,  遺伝子モジュール ,  ハブ遺伝子 ,  一卵性双生児 ,  肥満 ,  WGCNA

分類 (1件)： 精神障害  (GR03000A)

引用文献 (110件)：

• Revue medicale de Liege; Obesity: a model of complex interactions between genetics and environment; N Paquot, J De Flines, M Rorive; 67; 2012; 332-336; citation_id=CR1
• The surgeon General’s call to action to prevent and decrease overweight and obesity; 2001; CR2; citation_publisher=U.S. Department of Health and Human Services, Public Health Service, Office of the Surgeon General
• CMAJ; Diet in the management of weight loss; I Strychar; 174; 2006; 56-63; 10.1503/cmaj.045037; citation_id=CR3
• J Am Diet Assoc; Persons successful at long-term weight loss and maintenance continue to consume a low-energy, low-fat diet; SM Shick, RR Wing, ML Klem, MT McGuire, JO Hill, H Seagle; 98; 1998; 408-413; 10.1016/S0002-8223(98)00093-5; citation_id=CR4
• Am J Clin Nutr; Long-term weight losses associated with prescription of higher physical activity goals. Are higher levels of physical activity protective against weight regain?; DF Tate, RW Jeffery, NE Sherwood, RR Wing; 85; 2007; 954-959; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (10件)： 一卵性双生児 ,  発現 ,  加重 ,  遺伝子 ,  共発現 ,  ネットワーク分析 ,  BMI ,  モジュール ,  ハブ ,  同定