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J-GLOBAL ID:201802256668691171   整理番号:18A2004797

Agropyron mongolicum Kengにおける乾燥応答遺伝子および蛋白質のトランスクリプトームおよびプロテオーム解析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic and proteomic analyses of drought responsive genes and proteins in Agropyron mongolicum Keng
著者 (16件):
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巻: 14  ページ: 19-29  発行年: 2018年 
JST資料番号: W3003A  ISSN: 2214-6628  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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Agropyron mongolicum Kengは乾燥耐性多年生牧草である。干ばつストレスに対する応答における根底にある機構を解明するために,穏やかで厳しい干ばつ条件下でトランスクリプトームとプロテオミックプロファイリング分析を行った。de novo集合の後,92,752の単一遺伝子が791bpの平均サイズと1303bpのN50で得られた。70,732(76.26%)の単一遺伝子は,Nrデータベースにおける遺伝子と高い配列類似性を示した。差次的に発現した遺伝子の中で,446および418の遺伝子は,それぞれ,干ばつストレス下で上方および下方制御された。相対的および絶対的定量技術のための等圧タグを用いて,4105のユニークな蛋白質を同定した。それらの間で,255および280の蛋白質は,それぞれ上方および下方制御された。著者らは,干ばつストレス下ではまだ有意に発現されているが,有意に上方制御されているトップ45の遺伝子と蛋白質を選択した。アップレギュレーションされた遺伝子と蛋白質の間で,貯蔵蛋白質とデヒドリンがリストを支配した。細胞壁構造蛋白質,アミラーゼ,およびトリプシン阻害剤も乾燥ストレスによって上方制御された。葉緑体機能関連蛋白質は,有意に下方制御された蛋白質の大部分を占めた。経路分析により,ガラクトース加水分解,プロリン生合成,ペントースりん酸経路及び抗酸化系は有意にアップレギュレーションされたが,クロロフィル生合成,芳香族アミノ酸生合成,フラボノイド及びイソフラボノイド生合成の経路は全てダウンレギュレーションされた。本研究は,A.mongolicum Kengにおける将来の機能的ゲノミクス研究のための価値ある資源である干ばつストレスに対する応答におけるトランスクリプトームとプロテオミックプロファイルの両方を提供する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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遺伝子発現 
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