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J-GLOBAL ID：201802256931665469   整理番号：18A0966056

統合精巣トランスクリプトーム解析は,タイセイヨウサケにおける初期思春期の間に差次的に発現されたmiRNAおよびそれらのmRNA標的を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Integrative testis transcriptome analysis reveals differentially expressed miRNAs and their mRNA targets during early puberty in Atlantic salmon

著者 (11件)： Skaftnesmo K. O. (Institute of Marine Research, Bergen, Norway) ,  Edvardsen R. B. (Institute of Marine Research, Bergen, Norway) ,  Furmanek T. (Institute of Marine Research, Bergen, Norway) ,  Crespo D. (Reproductive Biology group, Department of Biology, Faculty of Science, Utrecht University, Utrecht, The Netherlands) ,  Andersson E. (Institute of Marine Research, Bergen, Norway) ,  Kleppe L. (Institute of Marine Research, Bergen, Norway) ,  Taranger G. L. (Institute of Marine Research, Bergen, Norway) ,  Bogerd J. (Reproductive Biology group, Department of Biology, Faculty of Science, Utrecht University, Utrecht, The Netherlands) ,  Schulz R. W. (Institute of Marine Research, Bergen, Norway) ,  Schulz R. W. (Reproductive Biology group, Department of Biology, Faculty of Science, Utrecht University, Utrecht, The Netherlands) ,  Wargelius A. (Institute of Marine Research, Bergen, Norway)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 801  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】脊椎動物における精巣の思春期成熟を実行する分子機構の理解は不完全である。このトピックは,早熟な雄の思春期が動物の福祉と成長に負の影響を及ぼすので,大西洋サケ養殖に関連している。著者らは,あるmiRNAが思春期の開始に関連するmRNAを調節すると仮定する。miRNAがサケの思春期開始時にmRNAを調節することを調べるために,著者らは発育の3段階におけるサケ精巣の統合トランスクリプトーム解析(miRNAとmRNA-seq)を行った。【結果】異なって発現したmiRNAは未成熟,思春期前および思春期のサケ精巣に関連した5つの異なる発現プロファイルにクラスター化した。これらのmiRNAの潜在的mRNA標的をmiRマップにより予測し,負に相関した発現パターンを示すmRNAを濾過した。要約すると,この分析は,未成熟脊椎動物精巣(miR-101,miR-137,miR-92b,miR-18a,miR-20a)で調節されることが知られているmiRNAを明らかにした。KEGG濃縮分析により,プロゲステロンシグナリングと細胞周期経路遺伝子は,これらの差次的に発現したmiRNAにより調節されることを見出した。思春期への移行の間に,著者らは以前に関連したmiRNA(7a/b/c),または新たに関連したmiRNA(miR-15c,miR-2184,miR-145および新規予測N7Aおよびb)の差次的発現をこの段階で見出した。KEGG濃縮分析は,Wnt,Hedgehogおよびアペリンのシグナル伝達経路のmRNAが,思春期への移行の間に潜在的に調節された標的であることを明らかにした。同様に,思春期段階におけるいくつかの調節されたmiRNAは以前に関連していた(miR-20a,miR-25,miR-181a,miR-202,let7c/d/a,miR-125b,miR-222a/b,miR-190a)か,または思春期の開始に対して連結した(miR-2188,miR-144,miR-731,miR-8157および新しいn2)。【結論】本研究は,特異的miRNAに対する初めての関連した精巣成熟および大西洋サケにおけるそれらの逆相関発現標的に対するものである。本研究は,脊椎動物における思春期への移行に関与する既知miRNAと関連経路の広い機能的保存を示す。分析はまた,精巣組織またはその成熟と以前に関連していないmiRNAを明らかにし,精巣におけるさらなる機能的研究を必要とする。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クラスタ化 ,  *mRNA ,  脊椎動物 ,  *思春期 ,  細胞周期 ,  遺伝子 ,  *精巣 ,  予測 ,  *Salmo salar ,  養殖
準シソーラス用語： 遺伝子発現パターン ,  遺伝子発現プロファイリング ,  分子機構 ,  *マイクロRNA ,  *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： miRNA ,  水産養殖 ,  Salmo salar ,  統合分析

分類 (3件)： 魚類  (FH02020K) ,  酵素生理  (EJ02020P) ,  動物性水産食品  (FJ13020C)

引用文献 (79件)：

• Gen Comp Endocrinol; Spermatogenesis in fish; RW Schulz, LR de França, J-J Lareyre, F Le Gac, F LeGac, H Chiarini-Garcia; 165; 2010; 390-411; 10.1016/j.ygcen.2009.02.013; CR1;
• Gen Comp Endocrinol; Neuroendocrinology of reproduction in teleost fish; Y Zohar, JA Muñoz-Cueto, A Elizur, O Kah; 165; 2010; 438-455; 10.1016/j.ygcen.2009.04.017; CR2;
• Gen Comp Endocrinol; Perspectives on fish gonadotropins and their receptors; B Levavi-Sivan, J Bogerd, EL Mañanós, A Gómez, JJ Lareyre; 165; 2010; 412-437; 10.1016/j.ygcen.2009.07.019; CR3;
• Gen Comp Endocrinol; Control of puberty in farmed fish; GL Taranger, M Carrillo, RW Schulz, P Fontaine, S Zanuy, A Felip; 165; 2010; 483-515; 10.1016/j.ygcen.2009.05.004; CR4;
• Dev Camb Engl; Spermatogenesis-preventing substance in Japanese eel; T Miura, C Miura, Y Konda, K Yamauchi; 129; 2002; 2689-2697; CR5;

タイトルに関連する用語 (9件)： 統合 ,  精巣 ,  トランスクリプトーム解析 ,  タイセイヨウサケ ,  初期 ,  発現 ,  miRNA ,  mRNA ,  標的