文献

J-GLOBAL ID：201802257055694890   整理番号：18A1365650

システム生物学のための統合解析シミュレータWinBEST-KITの開発

WinBEST-KIT: Integrated simulation environment for systems biology

著者 (1件)： 関口達也 (前橋工科大)
資料名： 前橋工科大学研究紀要  (Bulletin of Maebashi Institute of Technology)
号： 21  ページ： 29-36  発行年： 2018年03月31日 
JST資料番号： L5801A  ISSN： 1343-8867  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 以前に,代謝経路のような複雑な生化学的反応系を分析するために,WinBEST-KITと呼ばれる生化学的反応シミュレータを開発した。WinBEST-KITは,システム生物学の分野における実験研究者のための統合シミュレーション環境を提供する。WinBEST-KITの最も顕著な特徴の一つは,ユーザがグラフィカルユーザインタフェイスにおいてユーザ定義反応ステップシンボルを非常に容易にカスタマイズできることである。それは,ユーザがMichaelis-Menten方程式のような調整された標準(プリインストールされた)の数学的速度論方程式に加えて,反応段階として未知の速度論的機構を表現するために,それらのオリジナルの数学的速度論方程式の使用可能性を実現する。しかし,大規模な生化学的反応系の動力学に対する数学的モデリングは,いくつかの反応段階に対する確率的変動を必要とするという問題を考慮しなければならない。本研究では,ユーザがカスタマイズされたユーザ定義の反応ステップシンボルに確率的変動を含むことを可能にするWinBEST-KITの新しいバージョンを開発した。したがって,WinBEST-KITで分析される生化学反応系のモデルを構築する際に,確率論的変動を伴う反応ステップシンボルと従来の決定論的反応を含む反応ステップシンボルの両方を同時に含めることができる。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *生物学 ,  計算機科学 ,  *シミュレータ ,  技術開発 ,  GUI【計算機】 ,  シミュレーション ,  反応系 ,  動力学 ,  速度論 ,  *代謝経路 ,  生化学 ,  カスタム化 ,  化学反応 ,  モデリング ,  数学モデル
準シソーラス用語： *システム生物学 ,  化学反応系 ,  数理モデリング ,  統合解析

分類 (1件)： 理論生物学一般  (EA02010D)

タイトルに関連する用語 (5件)： システム生物学 ,  統合解析 ,  シミュレータ ,  KIT ,  開発