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J-GLOBAL ID：201802258830348303   整理番号：18A1309657

インド,Kachchh湾における微生物群集の機能的および系統学的多様性評価:生態学的足跡【JST・京大機械翻訳】

Functional and phylogenetic diversity assessment of microbial communities at Gulf of Kachchh, India: An ecological footprint

著者 (4件)： Gosai Haren B. (Department of Life Sciences, Maharaja Krishnakumarsinhji Bhavnagar University, Bhavnagar, Gujarat, India) ,  Sachaniya Bhumi K. (Department of Life Sciences, Maharaja Krishnakumarsinhji Bhavnagar University, Bhavnagar, Gujarat, India) ,  Panseriya Haresh Z. (Department of Life Sciences, Maharaja Krishnakumarsinhji Bhavnagar University, Bhavnagar, Gujarat, India) ,  Dave Bharti P. (Department of Life Sciences, Maharaja Krishnakumarsinhji Bhavnagar University, Bhavnagar, Gujarat, India)
資料名： Ecological Indicators  (Ecological Indicators)
巻： 93  ページ： 65-75  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1221A  ISSN： 1470-160X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 歴史的に汚染されたニッチにおける生態学的指標を同定するために,微生物群集とそれらの機能的構造を迅速で広範囲な方法で分析することは非常に重要である。そこで本研究では,高スループット配列決定プラットフォームNextSeq 499を用いて,2つの季節,すなわち,プレモンスーン(PreMN)とポストモンスーン(POMN)の間,インド,Kachchh湾,Navlkahi港(NAV)の油と石炭汚染堆積物の代謝可能性と系統発生的多様性を調べた。SEEDによる両メタゲノムの機能的多様性の評価,遺伝子オントロジー用語,蛋白質カテゴリー,蛋白質ファミリー数,およびGeneの京都Encyclopediaは,土着微生物群集の生体異物化合物分解能を明らかにした。また,結果は,POMNと比較して,PreMNシーズンの間の芳香族化合物分解,重金属耐性,ストレス応答,および他の主要な生化学的サイクルに関与する遺伝子のより高い豊度を明らかにした。分類学的評価は,AlteromonadalesがNAVにおける門Proteobacteriaから優勢であることを示唆する。豊富な微生物群集とは別に,「稀な」コミュニティも生体異物化合物分解において主要な役割を果たしている可能性がある。統計解析は,多様性と豊かさが両方の季節の間,ほとんど類似していることを示した。両汚染メタゲノムにおける生体異物化合物分解および他の主要生化学サイクルにおける指標微生物群集の存在は,土着微生物の刺激が油および石炭汚染サイトの修復に対する有効な選択肢であることを意味する。さらに,高スループット配列によるこの実験から発生した情報は,特に石炭および油汚染生息場所の機能的および系統発生的微生物多様性に関する最初の報告である可能性がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 代謝 ,  系統発生 ,  統計解析 ,  *インド ,  遺伝子 ,  *微生物 ,  コミュニティ ,  *生態学 ,  石炭 ,  芳香族化合物 ,  タンパク質
準シソーラス用語： プロテオバクテリア ,  生体異物 ,  メタゲノム ,  *微生物コンソーシアム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 生態学的指標 ,  代謝ポテンシャル ,  多環芳香族炭化水素 ,  メタゲノム研究 ,  機能的遺伝子多様性

分類 (3件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  土壌汚染  (FB04100T) ,  海洋汚濁  (SB02040B)

タイトルに関連する用語 (7件)： インド ,  微生物群集 ,  系統学 ,  多様性 ,  評価 ,  生態 ,  足跡