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J-GLOBAL ID：201802258846097555   整理番号：18A0476636

非侵襲的皮膚スワブからの不完全な病原体検出はバイアス疾患推論【Powered by NICT】

Imperfect pathogen detection from non-invasive skin swabs biases disease inference

著者 (6件)： DiRenzo Graziella V. (Department of Biology, University of Maryland, College Park, MD, USA) ,  Campbell Grant Evan H. (U.S. Geological Survey, Patuxent Wildlife Research Center, SO Conte Anadromous Fish Research Lab, Turners Falls, MA, USA) ,  Longo Ana V. (Department of Biology, University of Maryland, College Park, MD, USA) ,  Che-Castaldo Christian (Department of Ecology and Evolution, Stony Brook University, Stony Brook, NY, USA) ,  Zamudio Kelly R. (Department of Ecology & Evolutionary Biology, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Lips Karen R. (Department of Biology, University of Maryland, College Park, MD, USA)
資料名： Methods in Ecology and Evolution  (Methods in Ecology and Evolution)
巻： 9  号： 2  ページ： 380-389  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2682A  ISSN： 2041-210X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 保存管理者は宿主個体群の疾患状態を評価するために,病原体罹患率と感染強度のような,パラメータの正確な推定に依存している。しかし,低レベル感染強度はサンプリング法または実験室診断試験によって失われるならば,これらの疾患計量はバイアスされる可能性がある。これら偽陰性は,病原体罹患率を過小評価し,感染者の平均感染強度を過大評価する。著者らの目的は二つの要素からなる。まず,El Cope,パナマの両生類群集から採取した無侵襲皮膚スワブでBatrachochytrium dendrobatidis(Bd)の偽陰性誤り率を定量化した。配列における2回両生類を拭き取っと,最近開発された階層的ベイズ推定量を使って個体群の疾患状態を評価した。第二に,現場採取及び実験室診断試験の不完全な病原体検出を同時に説明するために新しい階層的ベイズモデルを開発した。モデルの性能を評価し,シミュレーションを用いて,病原体罹患率と感染強度の推定におけるバイアスの大きさを定量化するために様々なサンプリング設計。皮膚スワブからBd検出確率は,宿主感染強度と関連していたことを示し,Bd感染<10遊走子は検出されの<95%の確率であった。不完全Bd検出は考慮されていなかったならば,Bd有病率は71%程度過小評価された。Bd両生類系では,この低レベル感染と持続する地方病性宿主集団における不完全な病原体検出のための補正の必要性を示している。より一般的には,著者らの結果は,他の疾患システムにおける研究デザインに対する意味,特に類似した目的,生物学,およびサンプリング決定をした。病原体検出における不確実性は,殆どの試料採取プロトコルと診断試験の固有の特性である,バイアスの大きさは,研究システム,感染の型,偽陰性誤り率に依存した。を事前にこの情報を知ることは困難であることから,著者らは最も慎重なアプローチは,すべての誤差が可能である仮定するとサンプリング設計を調整することによってそれらを収容することであることを提唱する。ここで提示したモデリング枠組みは,病原体罹患率と感染強度を推定する精度を改善した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： モデル ,  個体群 ,  両生類 ,  *病原体 ,  モデリング ,  不確実性 ,  プロトコル ,  感染 ,  罹患率 ,  推定量 ,  誤り率 ,  *バイアス
準シソーラス用語： 偽陰性 ,  *病原体検出 ,  *スワブ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 両生類 ,  Batrachochytrium dendrobatidis ,  ツボカビ ,  階層的ベイズモデル ,  占有モデル ,  パナマ

分類 (2件)： 異種生物間相互作用  (EE01050A) ,  微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

タイトルに関連する用語 (7件)： 非侵襲的 ,  皮膚 ,  スワブ ,  病原体検出 ,  バイアス ,  疾患 ,  推論