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J-GLOBAL ID：201802258926272034   整理番号：18A0966115

Cajanus cajanにおけるmiRNAとlncRNAのゲノムワイド同定【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification of miRNAs and lncRNAs in Cajanus cajan

著者 (5件)： Nithin Chandran (Computational Structural Biology Lab, Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Kharagpur, Kharagpur, India) ,  Thomas Amal (Computational Structural Biology Lab, Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Kharagpur, Kharagpur, India) ,  Thomas Amal (Present address: Molecular and Computational Biology, Department of Biological Sciences, University of Southern California, Los Angeles, USA) ,  Basak Jolly (Department of Biotechnology, Visva-Bharati, Santiniketan, India) ,  Bahadur Ranjit Prasad (Computational Structural Biology Lab, Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Kharagpur, Kharagpur, India)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 878  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非コードRNA(ncRNA)は遺伝子発現の転写後調節(PTGR)における重要なプレーヤーである。一方で,マイクロRNA(miRNA)はメッセンジャーRNA安定性と翻訳阻害のレベルで遺伝子発現を負に調節する豊富なクラスの小ncRNA(~22nt長)である。一方,長いncRNA(lncRNA)は転写レベルでアップレギュレーションとダウンレギュレーションの両方の役割を果たす転写非蛋白質コードRNA分子(>200nt)の大きくて多様なクラスである。世界の熱帯および亜熱帯地域で成長したマメ科のマメ科植物,Cajanus cajanは,世界的にvege食者または非常に乏しい個体群に対する高い価値の蛋白質の供給源である。したがって,C.cajanにおけるmiRNAおよびlncRNAのゲノム全体の同定は,作物の多様性を改善するための可能な意味を持つPTGRにおけるそれらの役割を理解するために非常に重要である。著者らは,118ファミリーに属するC.cajanにおける616の成熟miRNAを同定し,そのうち578は新規であり,MirBase21において報告されていない。全部で1373の標的配列を180のmiRNAに対して同定した。これらのうち,298の標的を蛋白質レベルで特性化した。さらに,3919のlncRNAも予測した。さらに,66miRNAにより標的化される予測lncRNAの87を同定した。植物におけるmiRNAおよびlncRNAは,収量,品質およびストレス耐性を含む多様な形質を制御することが知られている。その農業の重要性と薬用価値のために,C.cajanにおける同定されたmiRNA,lncRNAおよびそれらの標的は,より良い品質作物を改善するためのゲノム編集に役立つ可能性がある。ncRNAに基づく細胞調節ネットワークの完全な理解は,C.cajan農業形質の改善を助けるであろう。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子発現 ,  タンパク質 ,  ダウンレギュレーション ,  農作物 ,  予測 ,  mRNA ,  アップレギュレーション ,  *ゲノム ,  個体群 ,  キャラクタリゼーション ,  品質 ,  *RNA【核酸】
準シソーラス用語： ストレス耐性 ,  *非翻訳長鎖RNA ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： miRNA ,  LncRNA ,  Cajanus Cajan ,  SSR署名 ,  ゲノムワイド解析

分類 (3件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (95件)：

• Plant Foods for Human Nutrition; Factors affecting the protein quality of pigeonpea (Cajanus cajan L); U Singh, BO Eggum; 34; 4; 1984; 273-283; 10.1007/BF01126556; citation_id=CR1
• Sharma S, Agarwal N, Verma P: Pigeon pea (Cajanus cajan L.): A Hidden Treasure of Regime Nutrition. Journal of Functional And Environmental Botany 2011, 1(2):91-101.
• Nene Y, Hall SD, Sheila V: The pigeonpea: CAB International; 1990.
• Field Crops Res; Variation among accessions of pigeonpea (Cajanus cajan) in osmotic adjustment and dehydration tolerance of leaves; D Flower, M Ludlow; 17; 3; 1987; 229-243; 10.1016/0378-4290(87)90037-2; citation_id=CR4
• Eur J Agron; Patterns of osmotic adjustment in pigeonpea - its importance as a mechanism of drought resistance; GV Subbarao, YS Chauhan, C Johansen; 12; 3-4; 2000; 239-249; 10.1016/S1161-0301(00)00050-2; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： Cajanus ,  miRNA ,  lncRNA ,  ゲノム ,  同定