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J-GLOBAL ID：201802259003825165   整理番号：18A0161825

isomiR発現プロファイルに基づく新しい腫瘍バイオマーカー【Powered by NICT】

Novel tumor biomarker based on isomiR expression profiles

著者 (2件)： Chen Liang (Faculty of Health Sciences, University of Macau, Macau S.A.R., China) ,  Wong Garry (Faculty of Health Sciences, University of Macau, Macau S.A.R., China)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2017  号： BIBM  ページ： 2328-2329  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ディープシークエンシング技術の発展に伴い,イソ型マイクロRNA(miRNAのイソ型)は細胞型,組織及び異なる細胞発育段階の種々の一貫して観察された。miRNA遺伝子の生成物としてmiRNAイソ型,長さと位置の成熟miRNAとは異なる変形である。最近,多くの研究はisomiRに強調し,そのサブタイプは,異なる腫瘍における発現を異なって見出した。本研究で筆者らは,TCGAデータセットにおける腫瘍と正常試料の間の異なるisomiR変異体特徴を発見するためのその発現の代わりにisomiRの変異体指数を適用した革新的。微分解析を行うisomiRの四つの異なる変異体指標を使用し,また彼らはisomiR型の数,isomiR平均長さ,正準配列(WAZNVC)と情報エントロピーに基づく指数(MIH)によるヌクレオチドの加重平均サイズである。結果isomiRの変異体指標を示した腫瘍と隣接正常組織,isomiRの変異体指標は,腫瘍バイオマーカー発見のための良好な観測対象として役立つことを明らかにした間に有意に異なっていた。我々のアプローチは,腫瘍マーカーの最適な組み合わせを選択するために一つだけ別に取り出す交差確認(LOOCV)を組み合わせたサポートベクトルマシン(SVM)法を採用した。Copyright 2018 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： ヌクレオチド ,  遺伝子 ,  サポートベクトルマシン ,  *腫瘍マーカー ,  成長段階 ,  *腫瘍
準シソーラス用語： 加重平均 ,  情報エントロピー ,  サブタイプ ,  細胞型 ,  マイクロRNA ,  アイソフォーム ,  *遺伝子発現プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 医学的検査一般  (GC02010L) ,  生体物質一般  (EB02010G)

タイトルに関連する用語 (2件)： 発現プロファイル ,  腫瘍バイオマーカー