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J-GLOBAL ID：201802259014388715   整理番号：18A1813153

深海堆積物メタゲノムからの新規メタロ-β-ラクタマーゼPNGM-1:結晶化とX線結晶学的解析【JST・京大機械翻訳】

The novel metallo-β-lactamase PNGM-1 from a deep-sea sediment metagenome: crystallization and X-ray crystallographic analysis

著者 (11件)： Park Kwang Seung (National Leading Research Laboratory of Drug Resistance Proteomics, Department of Biological Sciences, Myongji University, 116 Myongjiro, Yongin, Gyeonggido17058, Republic of Korea) ,  Hong Myoung-Ki (Department of Biological Sciences, Konkuk University, Hwayang-dong, Gwangjin-gu, Seoul05029, Republic of Korea) ,  Jeon Jin Wan (National Leading Research Laboratory of Drug Resistance Proteomics, Department of Biological Sciences, Myongji University, 116 Myongjiro, Yongin, Gyeonggido17058, Republic of Korea) ,  Kim Ji Hwan (National Leading Research Laboratory of Drug Resistance Proteomics, Department of Biological Sciences, Myongji University, 116 Myongjiro, Yongin, Gyeonggido17058, Republic of Korea) ,  Jeon Jeong Ho (National Leading Research Laboratory of Drug Resistance Proteomics, Department of Biological Sciences, Myongji University, 116 Myongjiro, Yongin, Gyeonggido17058, Republic of Korea) ,  Lee Jung Hun (National Leading Research Laboratory of Drug Resistance Proteomics, Department of Biological Sciences, Myongji University, 116 Myongjiro, Yongin, Gyeonggido17058, Republic of Korea) ,  Kim Tae Yeong (National Leading Research Laboratory of Drug Resistance Proteomics, Department of Biological Sciences, Myongji University, 116 Myongjiro, Yongin, Gyeonggido17058, Republic of Korea) ,  Karim Asad Mustafa (National Leading Research Laboratory of Drug Resistance Proteomics, Department of Biological Sciences, Myongji University, 116 Myongjiro, Yongin, Gyeonggido17058, Republic of Korea) ,  Malik Sumera Kausar (National Leading Research Laboratory of Drug Resistance Proteomics, Department of Biological Sciences, Myongji University, 116 Myongjiro, Yongin, Gyeonggido17058, Republic of Korea) ,  Kang Lin-Woo (Department of Biological Sciences, Konkuk University, Hwayang-dong, Gwangjin-gu, Seoul05029, Republic of Korea) ,  Lee Sang Hee (National Leading Research Laboratory of Drug Resistance Proteomics, Department of Biological Sciences, Myongji University, 116 Myongjiro, Yongin, Gyeonggido17058, Republic of Korea)
資料名： Acta Crystallographica Section F  (Acta Crystallographica Section F)
巻： 74  号： 10  ページ： 644-649  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2479A  ISSN： 2053-230X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： メタロ-β-ラクタマーゼ(MBL)は主なグラム陰性病原体と環境種に存在し,カルバペネムのような抗生物質のβ-ラクタム環を加水分解する能力のために大きな健康リスクをもたらす。PNGM-1は,抗生物質時代を前処理する深海堆積物からメタゲノムライブラリーから同定されたサブクラスB3MBL蛋白質の最初の報告例であった。本研究では,PNGM-1を過剰発現し,精製し,結晶化した。天然およびセレノメチオニン置換PNGM-1の結晶は,それぞれ2.10および2.30Å分解能で回折した。天然およびセレノメチオニン標識PNGM-1結晶の両方は単斜晶空間群P2_1に属し,単位格子定数a=122,b=83,c=163Å,β=110°であった。Matthews係数(V_M)計算は,約31~58%の溶媒含有量に対応する非対称ユニット中の6~10分子の存在を示唆した。構造決定は現在進行中である。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 加水分解 ,  単斜晶系 ,  非対称性 ,  *β-ラクタマーゼ ,  病原体 ,  タンパク質 ,  *結晶 ,  抗生物質 ,  前処理 ,  *結晶化 ,  カルボン酸 ,  ラクタム
準シソーラス用語： 過剰発現 ,  β-ラクタム ,  *メタロ-β-ラクタマーゼ ,  *メタゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 深海堆積物 ,  Edisonシーマウント ,  メタゲノム ,  抗生物質耐性 ,  メタロ-β-ラクタマーゼ

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： カルバペネム

タイトルに関連する用語 (6件)： 深海堆積物 ,  メタゲノム ,  メタロ-β-ラクタマーゼ ,  結晶化 ,  X線結晶学 ,  解析