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J-GLOBAL ID：201802259053150460   整理番号：18A0793604

3D-RISM理論とストリング法に基づく蛋白質を通してのイオンと小分子輸送の最小自由エネルギー経路を発見するための新しい方法【JST・京大機械翻訳】

A new method for finding the minimum free energy pathway of ions and small molecule transportation through protein based on 3D-RISM theory and the string method

著者 (1件)： Yoshida Norio (Department of Chemistry, Graduate School of Science, Kyushu University, 744, Motooka, Nishiku, Fukuoka 819-0395, Japan)
資料名： Chemical Physics Letters  (Chemical Physics Letters)
巻： 699  ページ： 22-27  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0824A  ISSN： 0009-2614  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ストリング法と組み合わせた三次元参照相互作用サイトモデル(3D-RISM)理論に基づく蛋白質を通してのイオンの最小自由エネルギー経路(MFEP)と小分子輸送を見出すための新しい方法を提案した。3D-RISM理論は,与えられた蛋白質構造の周りの物質を輸送するための分布関数または平均力(PMF)のポテンシャルを生成する。PMF表面にストリング法を適用することにより,PMF表面上のMFEPを容易に決定できる。この方法を例としてチャンネルロドプシンのNa+伝導経路を考察するために適用した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分布関数 ,  *タンパク質 ,  ポテンシャル ,  *イオン ,  相互作用 ,  *三次元 ,  *自由エネルギー
準シソーラス用語： チャンネルロドプシン ,  蛋白質構造 ,  *分子輸送 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 3D-RISM ,  ストリング法 ,  イオンチャンネル ,  分子輸送

分類 (3件)： 反応速度論・触媒一般  (CB06010G) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  電解質水溶液  (CB05020K)

タイトルに関連する用語 (8件)： 3D ,  RISM理論 ,  蛋白質 ,  イオン ,  分子輸送 ,  自由エネルギー ,  経路 ,  発見