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J-GLOBAL ID：201802259681784909   整理番号：18A0492200

アシネトバクター・バウマンニにおけるOmp33 36の構造への統合的in silicoアプローチ【Powered by NICT】

An integrative in silico approach to the structure of Omp33-36 in Acinetobacter baumannii

著者 (6件)： Jahangiri Abolfazl (Department of Biology, Shahed University, Tehran, Iran) ,  Rasooli Iraj (Department of Biology, Shahed University, Tehran-Qom Express Way, Tehran, Iran) ,  Owlia Parviz (Department of Microbiology, Shahed University Faculty of Medical Sciences, Tehran, Iran) ,  Owlia Parviz (Molecular Microbiology Research Center (MMRC), Shahed University, Tehran, Iran) ,  Fooladi Abbas Ali Imani (Applied Microbiology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran) ,  Salimian Jafar (Chemical Injuries Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 72  ページ： 77-86  発行年： 2018年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 重篤な院内感染を引き起こす細菌,A.baumanniiにおけるOmp33 36は病原体代謝適応とその付着と関連し,ヒト上皮細胞への浸潤病原性因子である。この蛋白質はフィブロネクチンに結合することにより宿主細胞と細菌の相互作用に関与している。Omp33 36はオートファジーのアポトーシスと変調の誘導に加えてA.baumanniiに対する細胞毒性を与えた。本研究では,Omp33 36--蛋白質の3D構造への貫通に発射される総合戦略。配列内のシグナルペプチドを決定し,次に,トポロジーのみならず,蛋白質の二次及び三次構造を予測した。成熟蛋白質はシグナルペプチドとして残基における1 19が除去された14本鎖バレルとして同定された。得られた3Dモデルは,品質の点で評価した。,類似した蛋白質構造を見出すためにクエリーとして役立った。ヒットはその中で14本鎖を考慮したトポロジーについて分析した。最も認定モデルを精製し,その配列はその対応物類似の構造蛋白質(Klebsiella oxytocaからCymA)に整列した。Omp33 36の決定した構造は,この蛋白質の喪失と関連したそのポリン機能とカルバペネム耐性を正当化することができた。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 細胞毒性 ,  アポトーシス ,  病原体 ,  フィブロネクチン ,  上皮細胞 ,  ヒト ,  細菌 ,  ポリン ,  三次構造 ,  相互作用 ,  *シグナルペプチド ,  三次元 ,  位相幾何学 ,  タンパク質
準シソーラス用語： 蛋白質構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Omp34 ,  生物情報学 ,  A.baumannii ,  構造予測 ,  Topology ,  二次構造

分類 (3件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (1件)： 統合