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J-GLOBAL ID：201802259681923231   整理番号：18A1071010

ナノストリング技術によるFFPE肺癌サンプルにおけるALK融合転写産物の検出【JST・京大機械翻訳】

Detection of ALK fusion transcripts in FFPE lung cancer samples by NanoString technology

著者 (14件)： Evangelista Adriane F. (Molecular Oncology Research Center, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Zanon Maicon F. (Molecular Oncology Research Center, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Carloni Adriana Cruvinel (Molecular Oncology Research Center, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Paula Flavia E. de (Molecular Oncology Research Center, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Morini Mariana Andozia (Department of Pathology, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Ferreira-Neto Maressa (Molecular Oncology Research Center, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Soares Ibere Cauduro (Department of Pathology, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Miziara Jose Elias (Department of Thoracic Surgery, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Marchi Pedro de (Department of Clinical Oncology, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Scapulatempo-Neto Cristovam (Molecular Oncology Research Center, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Scapulatempo-Neto Cristovam (Department of Pathology, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Reis Rui M. (Molecular Oncology Research Center, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil) ,  Reis Rui M. (Life and Health Sciences Research Institute (ICVS), Health Sciences School, University of Minho, Braga, Portugal) ,  Reis Rui M. (ICVS/3B’s-PT Government Associate Laboratory, Braga/Guimaraes, Portugal)
資料名： BMC Pulmonary Medicine (Web)  (BMC Pulmonary Medicine (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 86  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7449A  ISSN： 1471-2466  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ALK再編成肺癌は特異的な病理学的および臨床的特徴を示し,抗ALK療法に反応する。したがって,ALK再編成の検出は,個人化肺癌治療のための基本である。最近,NanoString nカウンタのような新しい分子技術が開発され,より正確で感度の良いALK融合が検出されている。【方法】本研究において,FFPE肺癌患者のルーチン生検におけるNanoString nカウンター ALK-融合パネルを検証することを意図した。FISHおよび/または免疫組織化学により以前に検出されたように,全部で43の試料を分析し,13のALK陽性および30のALK陰性を分析した。【結果】NanoStringパネルは,EML4-ALK,KIF5B-ALKおよびTFG-ALK融合変異体の存在を検出した。著者らは,すべての13のALK陽性症例がNanoString方法論によって遺伝的異常を示したことを観察した。すなわち,6例(46.15%)はEML-ALK変異体1を示し,2つ(15.38%)はEML-ALK変異体2を示し,2つ(15.38%)はEML-ALK変異体3aを示し,3つ(23.07%)は変異体を示さなかったが,他の陽性試料と同様に5’/3’エキソン間に不平衡発現を示した。重要なことに,これらのすべての分析に対して,RNAの初期入力は100ngであり,いくつかのケースは低いRNA品質測定を示した。結論:本研究において,FFPE標本のルーチン肺生検におけるALK融合の評価におけるNanoString技術の大きな有用性を報告した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  パネル ,  FISH ,  患者 ,  免疫組織化学 ,  再編成 ,  生検 ,  計数器 ,  治療法 ,  *肺腫瘍 ,  病理学
準シソーラス用語： 肺生検 ,  ルーチン ,  個性化 ,  *転写産物 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ALK ,  ALK融合 ,  ナノストリング ,  FFPE

分類 (1件)： 呼吸器の腫よう  (GI04000G)

引用文献 (27件)：

• Science; Fusion of a kinase gene, ALK, to a nucleolar protein gene, NPM, in non-Hodgkin’s lymphoma; SW Morris, MN Kirstein, MB Valentine, KG Dittmer, DN Shapiro, DL Saltman; 263; 1994; 1281-4; 10.1126/science.8122112; CR1;
• Nature; Identification of the transforming EML4-ALK fusion gene in non-small-cell lung cancer; M Soda, YL Choi, M Enomoto, S Takada, Y Yamashita, S Ishikawa; 448; 2007; 561-6; 10.1038/nature05945; CR2;
• Cancer; The EML4-ALK fusion gene is involved in various histologic types of lung cancers from nonsmokers with wild-type EGFR and KRAS; DW-S Wong, EL-H Leung, KK-T So, IY-S Tam, AD-L Sihoe, L-C Cheng; 115; 2009; 1723-33; 10.1002/cncr.24181; CR3;
• Clin Cancer Res; KIF5B-ALK, a novel fusion oncokinase identified by an immunohistochemistry-based diagnostic system for ALK-positive lung cancer; K Takeuchi, YL Choi, Y Togashi, M Soda, S Hatano, K Inamura; 15; 2009; 3143-9; 10.1158/1078-0432.CCR-08-3248; CR4;
• Cell; Global Survey of Phosphotyrosine Signaling Identifies Oncogenic Kinases in Lung Cancer; K Rikova, A Guo, Q Zeng, A Possemato, J Yu, H Haack; 131; 2007; 1190-203; 10.1016/j.cell.2007.11.025; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： 肺癌 ,  サンプル ,  ALK ,  融合 ,  転写産物