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J-GLOBAL ID：201802260322014372   整理番号：18A0799282

ポプラ不定根の形成と発達に関与する長鎖非コードRNAの同定と特性化【JST・京大機械翻訳】

Identification and characterization of long non-coding RNAs involved in the formation and development of poplar adventitious roots

著者 (6件)： Liu Sian (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Liu Sian (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Sun Zimou (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Sun Zimou (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Xu Meng (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Xu Meng (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China)
資料名： Industrial Crops and Products  (Industrial Crops and Products)
巻： 118  ページ： 334-346  発行年： 2018年 
JST資料番号： W0732A  ISSN： 0926-6690  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 経済的に重要な木質種の栄養増殖には不定根の発根が必須である。発根を促進または阻害する遺伝的および生理学的機構のより良い理解は,樹木の商業的展開の成功の可能性を高めるであろう。増加する証拠は,長い非コードRNA(lncRNA)が広範囲の生物学的プロセスにおいて重要な調節的役割を果たすことを示している。近年のハイスループット配列決定技術の急速な発展により,多数のlncRNAが植物において同定されているが,木本植物におけるそれらはほとんど知られていない。ここでは,ゲノムワイド規模でポプラ不定根の異なる発生段階で発現したlncRNAを系統的に同定し,特性化した。計算解析を通して,著者らは5952の推定lncRNA,4481の遺伝子間lncRNA,761のアンチセンスlncRNA,および710のイントロンlncRNAを同定し,そのために構造と発現レベルの差異を分析した。また,蛋白質コード遺伝子とlncRNAの間の異なる発現レベルを分析した。34の差次的に発現された遺伝子は,cis-作用において144のlncRNAによって制御され,それは不定根発生におけるオーキシンの調節のための新しい展望を提供した。さらに,ポプラの根発生に関与するlncWOX5とlncWOX11の両方のlncRNAを同定し,特性化した:lncWOX5はWOX5とlncWOX11はWOX11を正に調節した。lncWOX5とlncWOX11の発見と特性化により,不定根形成と発生の理論的枠組みを明確に理解し,予備的に確立することができる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝 ,  *ハコヤナギ属 ,  イントロン ,  リグニン ,  オーキシン ,  *キャラクタリゼーション ,  高速度 ,  発根 ,  タンパク質 ,  生理学 ,  *RNA【核酸】
準シソーラス用語： 木本植物 ,  ハイスループット ,  非翻訳RNA ,  *不定根 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 長い非コードRNA ,  不定根 ,  ポプラ ,  RNA-seq ,  LnCWOX5 ,  LnCWOX11

分類 (3件)： 薬用植物  (FC03075M) ,  細胞・組織培養法  (EA03040R) ,  植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (6件)： ポプラ ,  不定根 ,  発達 ,  長鎖非コードRNA ,  同定 ,  特性化