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J-GLOBAL ID：201802260931948452   整理番号：18A0786457

種の複合体内の分類学的種の描写:試験ケースとしてのAeromonas培地と関連種【JST・京大機械翻訳】

Delineation of Taxonomic Species within Complex of Species: Aeromonas media and Related Species as a Test Case

著者 (16件)： Talagrand-Reboul Emilie (Equipe Pathogenes Hydriques Sante Environnements, UMR 5569 HSM, Universite de Montpellier) ,  Talagrand-Reboul Emilie (Departement d’Hygiene Hospitaliere, CHRU de Montpellier) ,  Roger Frederic (Equipe Pathogenes Hydriques Sante Environnements, UMR 5569 HSM, Universite de Montpellier) ,  Kimper Jean-Luc (Equipe Pathogenes Hydriques Sante Environnements, UMR 5569 HSM, Universite de Montpellier) ,  Colston Sophie M. (Department of Molecular and Cell Biology, University of Connecticut) ,  Graf Joerg (Department of Molecular and Cell Biology, University of Connecticut) ,  Latif-Eugenin Fadua (Unidad de Microbiologia, Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud, IISPV, Universidad Rovira i Virgili) ,  Figueras Maria Jose (Unidad de Microbiologia, Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud, IISPV, Universidad Rovira i Virgili) ,  Petit Fabienne (Normandie Univ, UNIROUEN, UNICAEN, Centre National de la Recherche Scientifique, M2C) ,  Petit Fabienne (Sorbonne Universites, UPMC, Centre National de la Recherche Scientifique, EPHE, UMR 7619 METIS) ,  Marchandin Helene (Equipe Pathogenes Hydriques Sante Environnements, UMR 5569 HSM, Universite de Montpellier) ,  Marchandin Helene (Departement de Bacteriologie, CHRU de Montpellier) ,  Jumas-Bilak Estelle (Equipe Pathogenes Hydriques Sante Environnements, UMR 5569 HSM, Universite de Montpellier) ,  Jumas-Bilak Estelle (Departement d’Hygiene Hospitaliere, CHRU de Montpellier) ,  Lamy Brigitte (Equipe Pathogenes Hydriques Sante Environnements, UMR 5569 HSM, Universite de Montpellier) ,  Lamy Brigitte (Departement de Bacteriologie, CHU de Nice)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 621  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Aeromonas培地は,水生生息場所で主に見出されるヒトおよび動物の日和見病原体であり,有意なゲノムおよび表現型不均一性に注目されている。著者らは現在,A.mediaと関連種A.livipolensisに関連する系統の個体群構造と多様性をより良く理解することを目的とした。41株は集団研究統合,多座遺伝学,系統発生学,比較ゲノミクス,表現型,ライフスタイル,進化的特徴に含まれていた。16の遺伝子ベースの多座系統発生は,3つのクレードを描写した。クレードは,14の全ゲノム配列において,系統ゲノムメトリックANI(平均ヌクレオチド同一性)およびisDDH(in silico DNA-DNAハイブリダイゼーション)により定義された異なるゲノムグループまたは遺伝子種に対応した。DL-乳酸利用,セフォキシチン感受性,ヌクレオチド特性,リボソームマルチオペロン多様性,および組換えと突然変異(すなわち進化モードにおける)の相対的影響における差異は,2つの種Aeromonas培地とAeromonas livipolensisを区別した。これらの2つの種の記述をそれに応じて行った。ゲノム計量と比較ゲノミクスは,第3のクレードが異なる遺伝子種であることを示唆した。種の描写に加えて,遺伝的およびゲノム的データ解析は,根およびA.media種複合体の中での二倍体形成決定因子に関するより包括的な知識を与えた。進化モードにおける主要な差異と同様に,特定のライフスタイルと表現型は,A.media複合体内の系統発生と種分化に関連する推定因子を表す可能性がある。最後に,本研究で提示された統合的および集団的アプローチは,種複合体で組織化された細菌属における分類学的種および集団構造の描写を簡潔にするために広く考慮されている。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヒト ,  遺伝 ,  表現型 ,  *Aeromonas ,  DNA【核酸】 ,  病原体 ,  遺伝学 ,  ゲノム ,  *複合体 ,  突然変異 ,  ライフスタイル ,  生息場所
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  クレード ,  比較ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 集団研究 ,  統合分類学 ,  Aeromonas ,  スペシエーション ,  種の複合体 ,  タキソゲノミクス ,  系統発生 ,  組換え

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： 種 ,  複合体 ,  試験 ,  Aeromonas ,  培地