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J-GLOBAL ID：201802261113750819   整理番号：18A1803406

単純な近原子分解能単一粒子3D再構成【JST・京大機械翻訳】

Rapid near-atomic resolution single-particle 3D reconstruction with SIMPLE

著者 (13件)： Reboul Cyril F. (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Biomedicine Discovery Institute, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Reboul Cyril F. (Australian Research Council Centre of Excellence in Advanced Molecular Imaging, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Kiesewetter Simon (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Biomedicine Discovery Institute, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Kiesewetter Simon (School of Mathematical Sciences, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Eager Michael (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Biomedicine Discovery Institute, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Eager Michael (Australian Research Council Centre of Excellence in Advanced Molecular Imaging, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Belousoff Matthew (Department of Microbiology, Biomedicine Discovery Institute, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Cui Tiangang (School of Mathematical Sciences, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  De Sterck Hans (School of Mathematical Sciences, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Elmlund Dominika (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Biomedicine Discovery Institute, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Elmlund Dominika (Australian Research Council Centre of Excellence in Advanced Molecular Imaging, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Elmlund Hans (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Biomedicine Discovery Institute, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia) ,  Elmlund Hans (Australian Research Council Centre of Excellence in Advanced Molecular Imaging, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia)
資料名： Journal of Structural Biology  (Journal of Structural Biology)
巻： 204  号： 2  ページ： 172-181  発行年： 2018年 
JST資料番号： W0838A  ISSN： 1047-8477  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 低温電子顕微鏡(cryo-EM)と単一粒子分析は,生物学的分子の近原子分解能構造の決定を可能にする。しかしながら,大規模な計算要件は,新しい画像処理ツールのスループットと迅速な試験を制限する。単一粒子投影画像の相対的三次元配向を決定するために,SIMPLEソフトウェア一式のアルゴリズム部分であるPRIMEを開発した。プライムは主に初期のab initio3D再構成の生成に使用されている。ここでは,PRIMEの背後にある戦略,確率的丘上昇による粒子間配向分布の反復推定が,近原子分解能単一粒子3D再構成に対する競合的アプローチを提供することを示した。収束速度を加速するための多数の数学的手法を導入し,ほぼ2桁の高速化をもたらした。多数の公開可能なデータセットに関する著者らの開発をベンチマークし,近原子分解能ab initio 3D再構成を,標準的なオーバーカウンタCPUワークステーションを用いて,時間の物質においてSIMPLEで得ることができると結論した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ワークステーション ,  画像処理 ,  三次元 ,  アルゴリズム ,  電子顕微鏡 ,  スループット ,  高速化 ,  ソフトウェア ,  電子顕微鏡観察 ,  ベンチマーク ,  *再構成 ,  計数器
準シソーラス用語： 低温電子顕微鏡 ,  *3D画像再構成 ,  *単一粒子 ,  *原子分解能 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 単一粒子 ,  3D再構成 ,  近原子分解能 ,  Cryo-EM ,  電子顕微鏡 ,  画像処理 ,  確率的Hillクライミング

分類 (4件)： 生体の顕微鏡観察法  (EA03050C) ,  電子顕微鏡,イオン顕微鏡  (BD02050B) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： 原子分解能 ,  単一粒子 ,  3D再構成