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J-GLOBAL ID：201802261544039701   整理番号：18A0821365

HIV-1のCD4依存性と中和感受性の基礎となる分子機構への洞察:異なる表現型を持つ分離株由来gp12sに関する比較分子動力学研究【JST・京大機械翻訳】

Insights into the molecular mechanism underlying CD4-dependency and neutralization sensitivity of HIV-1: a comparative molecular dynamics study on gp120s from isolates with different phenotypes

著者 (9件)： Li Yi (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, Yunnan University, Kunming, P. R. China. [e-mail] [e-mail]) ,  Deng Lei ,  Ai Shi-Meng ,  Sang Peng ,  Yang Jing ,  Xia Yuan-Lin ,  Zhang Zhi-Bi ,  Fu Yun-Xin ,  Liu Shu-Qun
資料名： RSC Advances (Web)  (RSC Advances (Web))
巻： 8  号： 26  ページ： 14355-14368  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7055A  ISSN： 2046-2069  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： HIV-1のエンベロープ(Env)はウイルス感染と免疫回避において重要な役割を果たす。前融合Envの構造は決定されており,種々のHIV-1分離株に対するCD4依存性および中和感受性に関連する表現型が同定されているが,これら2つの表現型の基礎となる詳細な構造動力学およびエネルギー論は不明のままである。本研究では,CD4依存性,中和抵抗性分離株H061.14およびCD4非依存性中和感受性R2株由来のgp120の2つの非リガンド構造モデルを構築し,続いて多重レプリカ分子動力学(MD)シミュレーションを行い,続いて自由エネルギー景観(FEL)構築を行った。MD軌跡の比較分析は,シミュレーションR2-gp120がH061.14-gp120より大きな構造ゆらぎ/偏差とより高い全体的立体配座柔軟性を示すことを明らかにした。局所立体配座柔軟性の密接な比較により,閉鎖三量体Envの文脈におけるgp41及び隣接gp120サブユニットとの直接相互作用を含む構造領域のいくつかは,H061.14-gp120におけるよりも有意に高い柔軟性を示し,CD4による誘導なしに三量体クラウン及びプライムgp41融合特性を開く可能性を示した。主成分分析(PCA)から得られた集団運動は,R2-gp120が中和感受性CD4結合状態への自発的遷移を起こしやすいが,H061.14-gp120は中和耐性非配位状態を維持する傾向があることを明らかにした。最後に,FELs間の比較により,R2-gp120はH061.14-gp120よりも大きな立体配座エントロピー,豊富な立体配座多様性及び低い熱安定性を有し,R2-gp120はH061.14-gp120よりCD4結合状態への遷移に対して高い傾向を有することを明らかにした。本結果は,R2-gp120とH061.14-gp120の間の動力学とエネルギー論の差が異なる状態(すなわち,R2-Env試料は閉鎖状態を維持するためにより容易に)を与え,CD4依存性/中和感受性に関連するHIV-1表現型の基礎となる分子機構を解明する。Copyright 2018 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 主成分分析 ,  *中性化 ,  *表現型 ,  *HIV1 ,  自由エネルギー ,  ウイルス感染 ,  *分子動力学 ,  三量体 ,  柔軟性 ,  相互作用 ,  *感受性 ,  シミュレーション ,  *CD4抗原 ,  立体配座
準シソーラス用語： HIVエンベロープ蛋白質gp120 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (12件)： HIV-1 ,  CD4 ,  依存性 ,  中和 ,  感受性 ,  基礎 ,  分子 ,  洞察 ,  表現型 ,  分離株 ,  分子動力学 ,  研究