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J-GLOBAL ID：201802261810106731   整理番号：18A1154390

卵巣癌における重要な予後遺伝子をスクリーニングするためのバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis to screen the key prognostic genes in ovarian cancer

著者 (5件)： Li Li (The Department of Obstetrics and Gynecology, First Affiliated Hospital, Second Military Medical University, Shanghai, People’s Republic of China) ,  Cai Shengyun (The Department of Obstetrics and Gynecology, First Affiliated Hospital, Second Military Medical University, Shanghai, People’s Republic of China) ,  Liu Shengnan (The Department of Obstetrics and Gynecology, First Affiliated Hospital, Second Military Medical University, Shanghai, People’s Republic of China) ,  Feng Hao (The Department of Obstetrics and Gynecology, First Affiliated Hospital, Second Military Medical University, Shanghai, People’s Republic of China) ,  Zhang Junjie (The Department of Obstetrics and Gynecology, First Affiliated Hospital, Second Military Medical University, Shanghai, People’s Republic of China)
資料名： Journal of Ovarian Research (Web)  (Journal of Ovarian Research (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 27  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7521A  ISSN： 1757-2215  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:卵巣癌(OC)は,予後不良で死亡率が高い婦人科腫瘍である。本研究は,バイオインフォマティクス解析によりOCの予後に関与する重要な遺伝子を同定するために行った。【方法】遺伝子発現データ(568の原発性OC組織,17の再発性OC組織,および8つの隣接正常組織を含む)およびOC患者の関連臨床情報を,癌ゲノム地図データベースからダウンロードした。データ前処理の後,クラスタ分析をRにおけるConsensusClusterPlusパッケージを用いて実施した。Rにおける石灰包装を用いて,特徴遺伝子を同定するために示差分析を行った。Kaplan-Meier(KM)生存分析に基づいて,予後的種子遺伝子を特徴遺伝子から選択した。重要な予後遺伝子をクラスタ分析とKM生存分析によりさらにスクリーニングした後,それらを機能的濃縮分析と多変量生存分析を行った。Rにおける生存パッケージを用いて,cox回帰分析を,重要な予後遺伝子を検証するために,GSE17260のマイクロアレイデータに対して実施した。【結果】合計3668の特徴遺伝子が得られ,そのうち75の遺伝子が予後的な種子遺伝子として同定された。次に,AXL,FOS,KLF6,WDR77,DUSP1,GADD45B,およびSLIT3を含む25の重要な予後遺伝子をスクリーニングした。特に,AXLとSLIT3は排卵周期に富んでいた。多変量生存分析は,重要な予後遺伝子がサンプルを効果的に区別することができ,予後と有意に関連することを示した。さらに,GSE17260は,重要な予後遺伝子がOCの予後と関連していることを確認した。【結論】AXL,FOS,KLF6,WDR77,DUSP1,GADD45B,およびSLIT3は,OCの予後に影響を及ぼす可能性がある。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 月経周期 ,  再発 ,  *卵巣腫瘍 ,  回帰分析 ,  死亡率 ,  DNAマイクロアレイ ,  クラスタ分析 ,  *遺伝子 ,  ゲノム ,  患者
準シソーラス用語： 多変量 ,  生存率分析 ,  遺伝子発現データ ,  予後不良 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 卵巣癌 ,  クラスタ分析 ,  重要な予後遺伝子 ,  機能的濃縮分析 ,  多変量生存分析

分類 (5件)： 腫ようの診断  (GE03020J) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (36件)：

• Int J Gynecol Cancer; Ovarian cancer: prevention, detection, and treatment of the disease and its recurrence. Molecular mechanisms and personalized medicine meeting report; F Modugno, RP Edwards; 22; 8; 2012; 45-57; 10.1097/IGC.0b013e31826bd1f2; CR1;
• Treating advanced ovarian cancer; UK Cancer; 2014; CR2;
• Advances in Nutrition; World Cancer Report 2014. Geneva, Switzerland: World Health Organization, International Agency for Research on Cancer, WHO Press, 2015; S Mcguire; 7; 2; 2016; 418-419; 10.3945/an.116.012211; CR3;
• Lancet; Ovarian cancer; GC Jayson, EC Kohn, HC Kitchener, JA Ledermann; 384; 9951; 2014; 1376-1388; 10.1016/S0140-6736(13)62146-7; CR4;
• BMB Rep; Overexpression of CXCR4 is significantly associated with cisplatin-based chemotherapy resistance and can be a prognostic factor in epithelial ovarian cancer; J Li, K Jiang, X Qiu; 47; 1; 2014; 33-38; 10.5483/BMBRep.2014.47.1.069; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： 卵巣癌 ,  予後 ,  遺伝子 ,  スクリーニング ,  バイオインフォマティクス ,  分析