ジャガイモ(Solanum tuberosum)の根圏生態学的ニッチのためのRalstonia Solanacearumの遺伝子発現プロファイル【Powered by NICT】

Duan Ting T.; Luo Yong P.; Kong Chao Y.; Gao Xiu D.; Zhao Xin; Gao Gang

文献

J-GLOBAL ID：201802262124916664 整理番号：18A0470030

ジャガイモ(Solanum tuberosum)の根圏生態学的ニッチのためのRalstonia Solanacearumの遺伝子発現プロファイル【Powered by NICT】

Gene expression profile of Ralstonia Solanacearum for the rhizosphere ecological niche of Solanum tuberosum

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資料名：
巻： 166 号： 3 ページ： 151-160 発行年： 2018年
JST資料番号： W1901A ISSN： 0931-1785 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

植物根分泌はシグナル分子,根圏生態学的ニッチにおける微生物に及ぼす影響を発揮すると見なすことができる。RNAマイクロアレイ技術を用いた感染後8時間,16時間および24時間,それぞれの時点でジャガイモ(Solanum tuberosum)の根分泌物環境下でのRalstonia solanacearumPO41の遺伝子発現プロファイルを得た。示差遺伝子発現解析,GO機能解析,クラスタ分析と経路解析のバイオインフォマティクスツールは,病原性遺伝子と他の関連遺伝子を見出すために行った。R.solanacearumの病原性因子は主に毒性蛋白質(Sec経路,Tat経路及びIII型分泌系(T3SS))の出力経路,エキソ多糖類の凝集と移動およびジャガイモ根分泌生態学的ニッチにおける鞭毛の走化性移動と接着に焦点を当てたが,非定型出力経路の毒性因子は主に折畳み及び非折畳み毒性蛋白質の出力を促進するSec(secB,secDF,yidc)とTat(tatA, tatC)経路に分布していた。fliIATPaseは明らかに上方制御された8時間後,III型分泌システムはPO41感染の初期段階でのみ活性であったことを示唆した。ホスホグルコムターゼとエピメラーゼ発現の上方制御は,エキソ多糖類(EPS)の病原性因子は,R.solanacearum感染の初期段階で合成されたことを示した。走化性受容体と運動蛋白質は24時間後でアップレギュレートされ明らかにした。著者らの研究は,R.solanacearumPO41は既に根分泌の刺激と24時間以内に根に定着したことを明らかにした。いくつかの病原性遺伝子はこの期間にアップレギュレートされた。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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菌類による植物病害

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