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J-GLOBAL ID:201802262539223083   整理番号:18A1063387

遺伝子型別マーカーを用いたインドウシ(Bos indicus)間の遺伝的関連性の分析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of genetic relatedness among Indian cattle (Bos indicus) using genotyping-by-sequencing markers
著者 (7件):
資料名:
巻: 49  号:ページ: 242-245  発行年: 2018年 
JST資料番号: T0281A  ISSN: 0268-9146  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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7つのインドのウシ品種に属する24匹の動物の遺伝的関連性を,ハイスループット遺伝子タイピング(GBS)マーカーを用いて研究した。GBSは,動物当たり平均約39百万の読み取りを伴う93.6百万の読み取りを生み出した。これらの個体において合計107488のSNPが同定された。読まれた1個のSNPのみを考慮すると,独立した読み取りを表す全部で60261個のSNPが,ウシ参照ゲノムを通して45kbの平均SNP対SNP距離で同定された。GBS-SNPマーカーの約24%は100kb以上であった。これらのうち,58322のSNPは,常染色体,1645からX染色体および28からY染色体にマッピングされた。X染色体上の平均SNP対SNP距離は91.3kbであったが,Y染色体上では1546.4kbであった。インドのウシの中のマイナーな対立遺伝子頻度は0.103(Ongole)から0.177(Siri)まで変化したが,ホルスタイン牛は0.089の最低値を持っていた。これは南アジアのウシにおけるGBSの最初の応用である。本研究で発生したベースライン情報は,この地域に属するウシの育種におけるGBSの実施を促す可能性がある。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
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JSTが定めた文献の分類名称とコードです
遺伝子の構造と化学  ,  分子遺伝学一般  ,  牛 

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