文献

J-GLOBAL ID：201802262737123995   整理番号：18A0146440

Rosettaを用いたWebアクセス可能な分子モデリング:すべての人を含む(ROSIE)Rosettaオンラインサーバ【Powered by NICT】

Web-accessible molecular modeling with Rosetta: The Rosetta Online Server that Includes Everyone (ROSIE)

著者 (7件)： Moretti Rocco (Department of Chemistry, Vanderbilt University, Nashville, Tennessee) ,  Lyskov Sergey (Department of Chemical and Biomolecular Engineering, The Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland) ,  Das Rhiju (Department of Biochemistry, Stanford University, Stanford, California) ,  Das Rhiju (Department of Physics, Stanford University, Stanford, California) ,  Meiler Jens (Department of Chemistry, Vanderbilt University, Nashville, Tennessee) ,  Gray Jeffrey J. (Department of Chemical and Biomolecular Engineering, The Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland) ,  Gray Jeffrey J. (Program in Molecular Biophysics, The Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland)
資料名： Protein Science  (Protein Science)
巻： 27  号： 1  ページ： 259-268  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2730A  ISSN： 0961-8368  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Rosetta分子モデル化ソフトウェアパッケージをモデリングと設計蛋白質,核酸,および他の生体高分子のための多数の実験的に検証されたツールを提供し,継続的に添加した新しいプロトコルであった。学術ユーザが利用可能な自由が,外部使用はUnixコマンドライン環境における専門知識の必要性により制限される。より広い聴衆に利用できるRosettaプロトコルにするために,著者らは以前に含む全員(ROSIE),アクセスRosettaプロトコルをホストするための共通の環境を提供することをロゼッタオンラインサーバと呼ばれるWebサーバを作成した。ROSIEプロトコル仕様フォーマット,Rosettaプロトコルの容易な実装を可能にする一つの単純化を述べた。異なる場所で複数の別々のファイルを作成する必要以前のフォーマットが,新しいフォーマットは,単一ファイルにおけるプロトコルの仕様を可能にした。この新しい,単純化したプロトコル仕様はROSIE下で利用可能なRosettaプロトコルの数が二倍以上であった。これらの新しい応用はpK_a定量,脂質アクセシビリティ計算,リボ核酸再設計,蛋白質-蛋白質ドッキング,蛋白質-低分子ドッキング,対称ドッキング,抗体ドッキング,サイクリック毒素結合,臨界結合ペプチド定量とマッピング小分子結合部位を含んでいる。ROSIEであるhttp://rosie.rosettacommons.orgで学術ユーザに自由に利用できる。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 小分子 ,  プロトコル ,  結合部位 ,  ドッキング ,  プログラムパッケージ ,  タンパク質 ,  ペプチド ,  生体高分子 ,  RNA【核酸】 ,  アクセシビリティ ,  *モデリング ,  *Web【情報システム】 ,  簡素化 ,  抗体
準シソーラス用語： 分子ドッキング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ウエブサーバー ,  分子モデリング ,  設計 ,  予測

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  計算機網  (JC03000K)

タイトルに関連する用語 (6件)： Web ,  アクセス ,  分子モデリング ,  人 ,  オンライン ,  サーバ