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J-GLOBAL ID：201802262896126861   整理番号：18A1349648

深海水平油流出に対する基礎植物Spartina alternifloraのトランスクリプトーム応答【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome response of the foundation plant Spartina alterniflora to the Deepwater Horizon oil spill

著者 (9件)： Alvarez Mariano (Department of Integrative Biology, University of South Florida, Tampa, Florida) ,  Ferreira de Carvalho Julie (UMR CNRS 6553 ECOBIO, OSUR, Universite de Rennes 1, Campus Scientifique de Beaulieu, Rennes, France) ,  Salmon Armel (UMR CNRS 6553 ECOBIO, OSUR, Universite de Rennes 1, Campus Scientifique de Beaulieu, Rennes, France) ,  Ainouche Malika L. (UMR CNRS 6553 ECOBIO, OSUR, Universite de Rennes 1, Campus Scientifique de Beaulieu, Rennes, France) ,  Cave-Radet Armand (UMR CNRS 6553 ECOBIO, OSUR, Universite de Rennes 1, Campus Scientifique de Beaulieu, Rennes, France) ,  El Amrani Abdelhak (UMR CNRS 6553 ECOBIO, OSUR, Universite de Rennes 1, Campus Scientifique de Beaulieu, Rennes, France) ,  Foster Tammy E. (Kennedy Space Center Ecological Program, Titusville, Florida) ,  Moyer Sydney (Department of Integrative Biology, University of South Florida, Tampa, Florida) ,  Richards Christina L. (Department of Integrative Biology, University of South Florida, Tampa, Florida)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 27  号： 14  ページ： 2986-3000  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Deepwater Horizon油漏れの深刻な影響にもかかわらず,基礎植物種Spartina alternifloraは,原油曝露の人為的ストレスに対する応答の機構を同定する機会を提供する,重い油化に対して弾力性があることを証明した。著者らは,原油曝露に応答するゲノムワイド転写パターンおよび遺伝子発現ネットワークを同定するために,カスタムDNAマイクロアレイを用いて,油に影響を受けた個体群および影響を受けない個体群から植物を評価した。さらに,著者らは,モデルグラスBrachidium distachyonのT-DNA挿入系統を用いて,原油応答に対する4つの新規候補遺伝子の寄与を評価した。トランスクリプトームにわたる炭化水素曝露に対するS.alternifloraの応答と生体異物特異的応答経路は,モデル植物Arabidopsis thalianaにおいて以前に同定されたものとほとんど重複しなかった。B.distachyonのT-DNA挿入系統の中で,揮発性生産に関与する1つ(ATTPS21)と遺伝子発現の後成的調節に関与する他の2つの候補遺伝子(ATTPS21)の追加的支持を見出し,それは原油に対する応答に重要である可能性がある。S.alternifloraにおける原油応答の構造は,モデル種A.thalianaのそれから独特であり,生体異物応答が植物種を通して高度に変動する可能性があることを示唆した。加えて,調節ネットワークの更なる研究は,後成的応答経路に関するより多くの情報から利益を得る可能性がある。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  原油 ,  弾性 ,  炭化水素 ,  ゲノム ,  個体群 ,  T-DNA ,  遺伝子発現 ,  Arabidopsis thaliana ,  DNAマイクロアレイ ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 生体異物 ,  *Spartina alterniflora ,  候補遺伝子 ,  ディープウォーター・ホライズン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ヌル ,  生態ゲノミクス ,  基礎種 ,  炭化水素の応答 ,  ヌル ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： 深海 ,  油流出 ,  基礎 ,  植物 ,  Spartina ,  トランスクリプトーム ,  応答