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J-GLOBAL ID：201802263188435705   整理番号：18A0823898

シーケンスセグメントの語周波数変動に基づく進化距離の新しい推定アルゴリズム【JST・京大機械翻訳】

A novel estimation algorithm of evolutionary distance based on the word frequency variation of sequence segment

著者 (2件)： Song Yong-Joon (School of Electrical Engineering, Korea Advanced Institute of Science and Technology, Daejeon, Korea) ,  Cho Dong-Ho (School of Electrical Engineering, Korea Advanced Institute of Science and Technology, Daejeon, Korea)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2018  号： BHI  ページ： 287-290  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 進化のモデルに基づいて,生物間の進化距離を計算するために,生物のゲノム配列に関する研究はアラインメント法を使用する。しかし,従来の研究において,全体のアルゴリズムの高い複雑さと完全な配列組立の必要性を必要とするという明確な欠点がある。したがって,近年,全体の配列に対する進行アラインメントのない単語頻度や各シーケンスの共通部分列のような断片的情報を用いることにより,配列間の関係を分析するためのアラインメントフリー法が研究されている。それにもかかわらず,アラインメントフリー法はまだ広く使用されていない。これは,これまでのアラインメントフリー法が数学よりも実験的にのみ実験的なアルゴリズムを提示しているからである。したがって,進化のモデルに基づく進化距離の数学的推定法を提案し,それが種々のアラインメントフリー法と比較して優れた性能を示すことを証明した。Copyright 2018 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *アルゴリズム ,  単語 ,  モデル ,  アラインメント ,  *周波数変動
準シソーラス用語： 推定法 ,  ゲノム配列 ,  *推定アルゴリズム , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  無線通信一般  (ND08010L)

タイトルに関連する用語 (6件)： シーケンス ,  セグメント ,  語 ,  周波数変動 ,  進化 ,  推定アルゴリズム