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J-GLOBAL ID：201802263754294045   整理番号：18A0970056

水中のγ-アミノ酪酸(GABA)の閉じた形と開放形の問題について ab initio分子動力学とメタ動力学研究【JST・京大機械翻訳】

On the issue of closed versus open forms of gamma-aminobutyric acid (GABA) in water: Ab initio molecular dynamics and metadynamics studies

著者 (2件)： Sharma Bikramjit (Department of Chemistry, Indian Institute of Technology Kanpur, Kanpur 208016, India) ,  Chandra Amalendu (Department of Chemistry, Indian Institute of Technology Kanpur, Kanpur 208016, India)
資料名： Journal of Chemical Physics  (Journal of Chemical Physics)
巻： 148  号： 19  ページ： 194503-194503-7  発行年： 2018年 
JST資料番号： C0275A  ISSN： 0021-9606  CODEN： JCPSA6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 一次神経伝達物質であるγ-アミノ酪酸(GABA)は異なる立体配座において異なる受容体部位への結合によりその活性を達成する。それは2つの主要な配座異性体を持つことが知られている。水におけるGABAの優先的立体配座に関する以前の研究は,開放型を報告するいくつかの結果と異なる結果を明らかにし,一方,他のものは閉鎖型をより安定させることを示した。著者らは,多くのオープン型の存在と,水におけるGABAの1つの閉じた形だけを,ab initioメタ動力学シミュレーションを通して見出した。開いた配座異性体のいくつかは等しいかより安定であるが,他のものは閉じた形よりも安定でない。自由エネルギー障壁は,異なる配座異性体が典型的な実験時間スケールで室温で相互変換可能であることを明らかにした。ab initio分子動力学シミュレーションを行い,水中におけるGABAの種々の配座異性体の相互変換とそれらの双極子モーメントをさらに研究し,水中のGABAの立体配座に関する実験との結合を行った。(翻訳著者抄録)【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 立体配座 ,  *分子動力学 ,  *開放型 ,  受容体 ,  双極子モーメント ,  神経伝達物質 ,  相互変換 ,  自由エネルギー ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  アミノカルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  動力学シミュレーション ,  配座異性体 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 分子の立体配置・配座  (BH05022J) ,  原子・分子のクラスタ  (BH09030O) ,  アミノ酸  (CF10070V)

物質索引 (1件)： GABA

タイトルに関連する用語 (8件)： 水中 ,  γ-アミノ酪酸 ,  GABA ,  形 ,  開放形 ,  分子動力学 ,  動力学 ,  研究