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J-GLOBAL ID:201802263764063123   整理番号:18A1250714

CESCにおける競合的内因性RNAに基づく異常lncRNA-miRNA-mRNAネットワークの再構築と分析【JST・京大機械翻訳】

Reconstruction and analysis of the aberrant lncRNA-miRNA-mRNA network based on competitive endogenous RNA in CESC
著者 (8件):
資料名:
巻: 119  号:ページ: 6665-6673  発行年: 2018年 
JST資料番号: D0326B  ISSN: 0730-2312  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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研究の成長体は,長い非コードRNA(lncRNA)がceRNAネットワークの主要部分と見なされていることを示している。これはmiRNAスポンジとして機能することによる蛋白質コード遺伝子発現の調節によるものと考えられる。しかしながら,頸部扁平上皮癌(CESC)におけるlncRNA仲介ceRNAの機能的役割および調節機構,ならびにCESC予後の潜在的予測に対するそれらの使用は,不明のままである。306の頸部扁平上皮癌組織および3つの隣接する頸部組織のmRNA,lncRNAおよびmiRNAの異常な発現プロフィールを,TCGAデータベースから得た。CESCにおけるlncRNA-miRNA ceRNAネットワークを構築した。一方,遺伝子オントロジー(GO)とKEGG経路分析を,CytosscapeプラグインBingoとDAVIDデータベースを用いて実行した。特異的に発現したプロファイルとして,合計493のlncRNA,70のmiRNA,および1921のmRNAを同定した。異常なlncRNA-miRNA ceRNAネットワークを,CESCにおいて構築し,それは,50のDElncRNA,18のDEmiRNA,および81のDEmRNAから成った。全体の生存率分析によると,50のlncRNAのうちの3つ,81のmRNAのうちの10,および18のmiRNAのうちの1つは,CESC(P値<0.05)を有する患者のための予後的バイオマーカーとして機能した。著者らは,ceRNAネットワークにおけるサブネットワークを抽出し,2つの新しいlncRNAが重要な遺伝子として認識されることを見出した。これらは,lncRNA ME3とlncRNA ADAMTS9-AS2を含んだ。本研究は,CESCにおけるlncRNA関連ceRNAネットワークのより良い理解に対する新しい洞察を提供し,新しく認識されたceRNAネットワークは,CESCの病因におけるlncRNA仲介ceRNA調節機構の理解を改善する助けとなるであろう。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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遺伝子発現 

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