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J-GLOBAL ID：201802264456321926   整理番号：18A1288147

神経ゲノムプロファイリングは,眼ティラピアにおいて一貫している脳部分間の異なる遺伝子発現プロファイルを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Neurogenomic Profiling Reveals Distinct Gene Expression Profiles Between Brain Parts That Are Consistent in Ophthalmotilapia Cichlids

著者 (15件)： Derycke Sofie (Operational Direction Taxonomy and Phylogeny, Royal Belgian Institute for Natural Sciences) ,  Derycke Sofie (Department of Biology, Ghent University) ,  Kever Loic (Laboratory of Functional and Evolutionary Morphology, University of Liege) ,  Kever Loic (Behavioural Biology Unit, Ethology and Animal Psychology, University of Liege) ,  Herten Koen (Department of Human Genetics, Genomics Core Facility, KU Leuven) ,  Van den Berge Koen (Department of Applied Mathematics, Computer Science and Statistics, Ghent University) ,  Van den Berge Koen (Bioinformatics Institute Ghent, Ghent University) ,  Van Steenberge Maarten (Operational Direction Taxonomy and Phylogeny, Royal Belgian Institute for Natural Sciences) ,  Van Steenberge Maarten (Section Vertebrates, Ichthyology, Royal Museum for Central Africa) ,  Van Houdt Jeroen (Department of Human Genetics, Genomics Core Facility, KU Leuven) ,  Clement Lieven (Department of Applied Mathematics, Computer Science and Statistics, Ghent University) ,  Clement Lieven (Bioinformatics Institute Ghent, Ghent University) ,  Poncin Pascal (Behavioural Biology Unit, Ethology and Animal Psychology, University of Liege) ,  Parmentier Eric (Laboratory of Functional and Evolutionary Morphology, University of Liege) ,  Verheyen Erik (Operational Direction Taxonomy and Phylogeny, Royal Belgian Institute for Natural Sciences)
資料名： Frontiers in Neuroscience (Web)  (Frontiers in Neuroscience (Web))
巻： 12  ページ： 136  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7087A  ISSN： 1662-453X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 外部および内部キューの検出は,脳における遺伝子発現を変化させる。これは,行動反応を支える神経回路網に影響を与える可能性がある。以前の研究は,遺伝子発現プロファイルが,個体内の主要な脳領域と異なる形態,認知能力および/または挙動を持つ種間で異なることを示している。しかしながら,すべての大解剖学的脳領域および類似の形態と挙動を有する種における遺伝子発現の詳細な記述は,欠けている。ここで著者らは,2つの繊毛種の脳を6つの大解剖学的領域に解剖した。Ophthalmoティラピア nasutaとO.ventralisは類似の形態と挙動を持ち,野生では時々交雑する。著者らは,他の雌との社会的設定において維持された雌間の差次的遺伝子発現を同定するために,3′mRNA配列決定および段階的統計的試験手順を用いた。著者らの結果は,遺伝子発現が種内の全6つの脳部分の間で実質的に異なることを示す:11577の評価された遺伝子のうち,8,748は他の脳部分の平均発現と比較して少なくとも1つの脳部分において差別的に発現する(DE)。これらのDE遺伝子のほとんど16%は,2よりも有意に高い|log_2Fc|を有していた。脳部分間の機能的差異は種間で一致した。特定の脳部分のDEである遺伝子の大部分(61~79%)は両種間で共有されていた。32の遺伝子だけが,種間の脳部分を横切る折畳み変化において有意差を示した。これらの遺伝子は主に輸送,膜貫通輸送,転写(及びその調節)及びシグナル伝達に関連している。さらに,統計的同等性試験により,各比較内で,平均89%の遺伝子が両種間で同等の折畳み変化を示すことを明らかにした。類似の形態と挙動を持つ密接に関連する種間の脳部分と保存パターン間の遺伝子発現の顕著な相違は,遺伝子と挙動の間の相互作用の解明が異なる脳領域の神経ゲノムプロファイリングから利益を得ることを示唆する。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 待ち行列 ,  繊毛 ,  神経回路網 ,  折畳み ,  *遺伝子発現 ,  相互作用 ,  *遺伝子 ,  *ティラピア ,  解剖学 ,  交雑 ,  mRNA
準シソーラス用語： 有意差 ,  差次的遺伝子発現 ,  脳領域 ,  *神経 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 小脳 ,  社会的行動 ,  cich蓋魚 ,  等価性試験 ,  遺伝子レベルFDR ,  神経ゲノミクス

分類 (2件)： 中枢神経系  (EJ12030F) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 神経 ,  ゲノム ,  プロファイリング ,  眼 ,  ティラピア ,  脳 ,  遺伝子発現プロファイル