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J-GLOBAL ID：201802264718006762   整理番号：18A2069966

アメリカナマズ(Ictalurus punctatus)におけるSox遺伝子ファミリーのゲノムワイド同定,系統発生および発現プロファイル【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification, phylogeny and expressional profile of the Sox gene family in channel catfish (Ictalurus punctatus)

著者 (18件)： Zhang Shiyong (National Genetic Breeding Center of Channel Catfish, Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Nanjing 210017, China) ,  Zhang Shiyong (The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China) ,  Chen Xiaohui (National Genetic Breeding Center of Channel Catfish, Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Nanjing 210017, China) ,  Chen Xiaohui (The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China) ,  Wang Minghua (National Genetic Breeding Center of Channel Catfish, Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Nanjing 210017, China) ,  Wang Minghua (The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China) ,  Zhang Wenyi (Key Laboratory of Genetic Breeding and Aquaculture Biology of Freshwater Fishes, Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuxi 214081, China) ,  Pan Jianlin (National Genetic Breeding Center of Channel Catfish, Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Nanjing 210017, China) ,  Qin Qin (National Genetic Breeding Center of Channel Catfish, Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Nanjing 210017, China) ,  Qin Qin (The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China) ,  Zhong Liqiang (National Genetic Breeding Center of Channel Catfish, Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Nanjing 210017, China) ,  Zhong Liqiang (The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China) ,  Shao Junjie (National Genetic Breeding Center of Channel Catfish, Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Nanjing 210017, China) ,  Sun Mengling (National Genetic Breeding Center of Channel Catfish, Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Nanjing 210017, China) ,  Jiang Hucheng (National Genetic Breeding Center of Channel Catfish, Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Nanjing 210017, China) ,  Jiang Hucheng (The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China) ,  Bian Wenji (National Genetic Breeding Center of Channel Catfish, Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Nanjing 210017, China) ,  Bian Wenji (The Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm, Nanjing 210014, China)
資料名： Comparative Biochemistry and Physiology. D. Genomics & Proteomics  (Comparative Biochemistry and Physiology. D. Genomics & Proteomics)
巻： 28  ページ： 17-26  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2148A  ISSN： 1744-117X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Sox遺伝子ファミリーはいくつかの魚種で系統的に特性化されているが,ナマズIctalurus punctatusでは特性化されていない。本研究において,25のSox遺伝子をチャンネルナマズゲノムにおいて同定し,それらの保存ドメインに基づいて7つのファミリーに分類した。SoxB群における8つの遺伝子(SoxB1サブグループにおける6つとSoxB2サブグループにおける2つ);SoxC群の5つの遺伝子;SoxDとSoxF群の3つの遺伝子;SoxE群の4つの遺伝子;そして,SoxHとSoxK群における1つの遺伝子。哺乳類Sox群,SoxA,G,IおよびJはナマズに存在しなかった。チャンネルナマズSox遺伝子におけるイントロンの数は,ゼロから13まで変化した。SOX遺伝子は17の染色体を通して不均一に分布していた。祖先脊椎動物Sox遺伝子(Sox1,Sox4,Sox9,Sox11およびSox19)の5つのメンバーは進化の間に硬骨魚特異的全ゲノム重複を経験し,現在,異なる染色体上に2つのコピーを持っている。発現プロファイル分析により,Sox遺伝子の蓄積は異なる組織と関連しており,発現パターンも各Sox遺伝子群と重複遺伝子の間で異なることを示した。本研究は,チャンネルナマズにおけるSox遺伝子ファミリーの包括的概観を構成し,この遺伝子ファミリーの進化に新しい洞察を提供する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *系統発生 ,  遺伝子重複 ,  遺伝子発現 ,  チャネル ,  硬骨魚類 ,  キャラクタリゼーション ,  哺乳類 ,  イントロン ,  *ゲノム ,  *遺伝子
準シソーラス用語： 遺伝子クラスタ ,  遺伝子発現パターン ,  ドメイン構造 ,  *遺伝子発現プロファイリング ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： チャンネルキャットフィッシュ ,  SOX遺伝子 ,  ゲノム構造 ,  ゲノム重複 ,  遺伝子発現

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： アメリカ ,  ナマズ ,  SOx ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  系統発生 ,  発現プロファイル