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J-GLOBAL ID：201802265026396570   整理番号：18A1031845

バリン/イソロイシン変異体はEV-A71エンテロウイルスのVP1配列における選択的圧力を駆動する【JST・京大機械翻訳】

Valine/isoleucine variants drive selective pressure in the VP1 sequence of EV-A71 enteroviruses

著者 (24件)： Duy Nghia Ngu (National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Vietnam) ,  Duy Nghia Ngu (University of Montpellier, ISEM, Montpellier Cedex 5, France) ,  Duy Nghia Ngu (Cirad, UMR 17, Intertryp, TA-A17/G, Campus International de Baillarguet, Montpellier Cedex 5, France) ,  Huong Le Thi Thanh (National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Vietnam) ,  Ravel Patrice (Institut de Recherche en Cancerologie de Montpellier (U1194), Campus Val d’Aurelle, Montpellier Cedex 5, France) ,  Huong Le Thi Song (Hai Phong Preventive Medicine Center, Hai Phong city, Vietnam) ,  Dwivedi Ankit (Institut de Biologie Computationnelle, MMVE, Montpellier, France) ,  Sessions October Michael (DUKE-NUS Graduate Medical School, Singapore, Singapore) ,  Hou Yan’An (DUKE-NUS Graduate Medical School, Singapore, Singapore) ,  Chua Robert (DUKE-NUS Graduate Medical School, Singapore, Singapore) ,  Kister Guilhem (Faculty of Pharmacy, University of Montpellier, Montpellier Cedex 5, France) ,  Afelt Aneta (Faculty of Geography and Regional Studies, University of Warsaw, Warsaw, Poland) ,  Moulia Catherine (University of Montpellier, ISEM, Montpellier Cedex 5, France) ,  Gubler Duane J. (DUKE-NUS Graduate Medical School, Singapore, Singapore) ,  Thiem Vu Dinh (National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Vietnam) ,  Thanh Nguyen Thi Hien (National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Vietnam) ,  Devaux Christian (Institut de Recherche pour le Developpement (IRD), Marseille cedex 02, France) ,  Duong Tran Nhu (National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Vietnam) ,  Hien Nguyen Tran (National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Vietnam) ,  Cornillot Emmanuel (Institut de Recherche en Cancerologie de Montpellier (U1194), Campus Val d’Aurelle, Montpellier Cedex 5, France) ,  Cornillot Emmanuel (Institut de Biologie Computationnelle, MMVE, Montpellier, France) ,  Gavotte Laurent (University of Montpellier, ISEM, Montpellier Cedex 5, France) ,  Frutos Roger (Cirad, UMR 17, Intertryp, TA-A17/G, Campus International de Baillarguet, Montpellier Cedex 5, France) ,  Frutos Roger (Universite de Montpellier, IES - Institut d’Electronique et des Systemes, Montpellier, France)
資料名： BMC Infectious Diseases (Web)  (BMC Infectious Diseases (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 333  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7430A  ISSN： 1471-2334  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】2011年~2012年に,ベトナム北部は,その最初の大規模手足および口病(HFMD)流行を経験した。2011年において,主要なHFMD流行は,致命的事例によって南ベトナムにおいてさらに報告した。この2011~2012年の発生は,北ベトナムで発生した最初のものであり,疾患の病因,起源および動態を研究するための基礎を提供した。ここでは,2011~2012年の発生の間および以前に北ベトナムを通して分離された株のVP1遺伝子の分析を報告する。【方法】北ベトナムからの106のEV-A71分離株と中央ベトナムからの2つのVP1遺伝子を配列した。配列アラインメントを核酸と蛋白質レベルで分析した。遺伝子多型も分析した。臨床パラメータとアミノ酸変異を相関させるために,因子応答分析を行った。【結果】配列は4つの系統発生クラスタに分布した。3つのクラスターはサブgenogroup C4に対応し,最後のクラスターはsubgenogroup C5に対応した。各クラスタは異なる多型特性を示した。蛋白質は高度に保存されていたが,Isoleucine(I)またはValin(V)のみを含む3つの部位が特性化された。イソロイシン/バリン変動性はクラスタと一致した。I/V変異体の時空間分析は2011年に出現し,2012年に出現した全ての変異体は同じではなく,2011~2012年の発生前の地域に存在することを示した。ある種のI/V変異体と民族性および重症度の間にいくつかの相関が見られた。結論:2011年~2012年の発生は,南ベトナムまたは他の地域からの外来株によるものではなく,既に存在し,北ベトナムにおいて低レベルで循環していた。しかし,発生を誘発するものは不明のままである。遺伝的クラスタに適合するI/V変異体に選択的圧力を適用した。I/V変異体は病原性と相関する他のウイルスで示された。これはEV-A71で調査されるべきである。I/V変異体は,循環EV-A71株を調査し同定するための容易で効率的な方法である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 病原性 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  核酸 ,  クラスタ ,  系統発生 ,  タンパク質 ,  手足口病 ,  キャラクタリゼーション ,  ベトナム社会主義共和国 ,  遺伝子多型 ,  *エンテロウイルス ,  病因 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  分枝鎖アミノ酸 ,  第一アミン

著者キーワード (5件)： VP1 ,  HFMD ,  エンテロウイルス ,  EV-A71 ,  ベトナム

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  公衆衛生  (GB02000X)

物質索引 (2件)： イソロイシン ,  バリン

引用文献 (33件)：

• Bioinformatics; ProtTest: selection of best-fit models of protein evolution; F Abascal, R Zardoya, D Posada; 21; 2005; 2104-2105; 10.1093/bioinformatics/bti263; CR1;
• Virus Res; Identification of enterovirus 71 isolates from an outbreak of hand, foot and mouth disease (HFMD) with fatal cases of encephalomyelitis in Malaysia; S Abu Bakar, HY Chee, MF Al-Kobaisi, J Xiaoshan, CK Bing, LS Kit; 61; 1999; 1-9; 10.1016/S0168-1702(99)00019-2; CR2;
• Ann Acad Med Singap; Epidemiology and control of hand, foot and mouth disease in Singapore; LW Ang, BK Koh, KP Chan, LT Chua, L James, KT Goh; 38; 2009; 106-112; CR3;
• J Virol; Molecular epidemiology and evolution of enterovirus 71 strains isolated from 1970 to 1998; BA Brown, MS Oberste, JP Alexander, ML Kennett, MA Pallansch; 73; 1999; 9969-9975; CR4;
• J Virol; A single mutation in the VP1 of Enterovirus 71 is responsible for increased virulence and Neurotropism in adult interferon-deficient mice; EA Caine, LH Moncla, MD Ronderos, TC Friedrich, JE Osorio; 90; 2016; 8592-8604; 10.1128/JVI.01370-16; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： バリン ,  イソロイシン ,  変異体 ,  EV ,  エンテロウイルス ,  VP1