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J-GLOBAL ID：201802265038637144   整理番号：18A0965517

実生乾燥ストレスに応答したレンズマメ(Lens culinaris Medikus)のトランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome analysis of lentil ( Lens culinaris Medikus) in response to seedling drought stress

著者 (7件)： Singh Dharmendra (Division of Genetics, Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Singh Chandan Kumar (Division of Genetics, Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Taunk Jyoti (Division of Genetics, Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Tomar Ram Sewak Singh (National Research Centre on Plant Biotechnology, ICAR, New Delhi, India) ,  Chaturvedi Ashish Kumar (Division of Plant Physiology, Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Gaikwad Kishor (National Research Centre on Plant Biotechnology, ICAR, New Delhi, India) ,  Pal Madan (Division of Plant Physiology, Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 206  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】乾燥ストレスは作物植物における最も有害な非生物的ストレスの1つである。中程度の干ばつ耐性作物として,レンズマメは天水地域の主要作物であり,干ばつストレス耐性研究作業のための適切な候補である。空気曝露による苗段階での水耕栽培条件下での干ばつ耐性ストレスのスクリーニングは,対照的な形質を持つ遺伝子型を選択するための効率的な技術である。トランスクリプトーム解析は,特に,完全ゲノム配列に関する情報が利用できないので,価値ある資源,特にレンズマメに対して提供する。したがって,本研究は実施された。【結果】本研究は,干ばつ耐性(PDL-2)および乾燥感受性(JL-3)品種における実生段階での干ばつストレスへの適応を与えることに関与する生化学的機構およびトランスクリプトーム変化を理解するために行われた。異なる生理学的および生化学的パラメータの間で,クロロフィル,RWCおよびカタラーゼ活性がJL-3において有意に減少した一方,プロリン,グリシンベタイン含有量およびSOD,APXおよびGPXの活性において,PDL-2に比較して有意な増加が記録された。干ばつストレス下でのPDL-2とJL-3の間のトランスクリプトーム変化を,Illina HiSeq2500プラットフォームを用いて評価した。塩基の総数は5.1から6.7Gbの範囲であった。PDL-2およびJL-3の制御および乾燥処理cDNAライブラリーの配列分析は,それぞれ,2011年,2008年,2000年および1991年のそれぞれのN50値により,74032,75500,78328および81523のコンティグを生産した。それらの対照と共に乾燥処理した遺伝子型の差次的遺伝子発現は,全部で11,435の上方制御され,6,934の下方制御された転写物を明らかにした。DEGの機能的分類のために,KEGG経路アノテーション分析は,176が分子過程内にある全部で413のGOアノテーション用語,細胞内で128,生物学的過程群で109を抽出した。【結論】転写プロファイルは,レンズマメにおける干ばつ耐性のための基礎となる機構を解読するための基礎を提供する。2つの遺伝子型における転写調節,シグナル伝達および二次代謝は,厳しい干ばつ下で苗段階で有意差を明らかにした。著者らの発見は,レンズマメにおける干ばつ耐性を改善するための候補遺伝子の役割を示唆する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 品種 ,  アップレギュレーション ,  耐干性 ,  ダウンレギュレーション ,  遺伝子発現 ,  感受性 ,  *実生 ,  干ばつ ,  *トランスクリプトーム ,  *レンズマメ ,  遺伝子型
準シソーラス用語： ストレス耐性 ,  非生物的ストレス ,  *トランスクリプトーム解析 ,  *乾燥ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 異なる遺伝子発現 ,  干ばつストレス ,  レンズマメ ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 野菜とその加工品  (FJ11020O) ,  豆類  (FC03035U)

引用文献 (93件)：

• Plant Mol Biol Rep; Nuclear DNA content of some important plant species; K Arumuganathan, ED Earle; 9; 1991; 208-218; 10.1007/BF02672069; CR1;
• Reda A. Lentil (Lens culinaris Medikus) Current status and future prospect of production in Ethiopia. Adv Plants Agric Res. 2015. doi:10.15406/apar.2015.02.00040.
• FAO: Food and Agricultural Organization. 2013.http://www.fao.org. Accessed 1 Feb 2016.
• Plant Cell Environ; Drought- and desiccation-induced modulation of gene expression in plants; S Ramanjulu, D Bartels; 25; 2002; 141-151; 10.1046/j.0016-8025.2001.00764.x; CR4;
• Plant J; Correlation between the induction of a gene for δ1-pyrroline-5-carboxylate synthetase and the accumulation of proline in Arabidopsis thaliana under osmotic stress; Y Yoshiba, T Kiyosue, T Katagiri, H Ueda, T Mizoguchi, K Yamaguchi Shinozaki, K Wada, Y Harada, K Shinozaki; 7; 1995; 751-760; 10.1046/j.1365-313X.1995.07050751.x; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： 実生 ,  乾燥ストレス ,  応答 ,  レンズマメ ,  Lens ,  トランスクリプトーム解析